520 年，伊庇法尼烏斯被東羅馬帝國皇帝查士丁一世任命成為君士坦丁堡牧首。

當(dāng)新查爾西頓正統(tǒng)觀念（Neo-Chalcedonism）傳播的時(shí)候，他接受了他的前任約翰二世與霍米斯達(dá)斯締結(jié)的東西方教會(huì)和平的條款。為了恢復(fù)普遍的和平，他要求教皇，自從君士坦丁堡的發(fā)生危機(jī)以來，他的權(quán)威得到了加強(qiáng)，不要過于嚴(yán)格地將妥協(xié)主教的名字排除在雙聯(lián)畫之外。因此，他承諾遵循與羅馬教皇相同的名單。他對(duì)本都、亞洲和東方主教的道歉以令人欽佩的風(fēng)格寫成?；裘姿惯_(dá)斯的提議在536年君士坦丁堡主教會(huì)議提出，得到了門納斯（Menas of Constantinople）對(duì)于他的贊譽(yù)。

皇帝對(duì)于阿里烏斯派的反對(duì)而采取的嚴(yán)厲措施導(dǎo)致在意大利的東哥特領(lǐng)袖狄奧多里克大帝（信仰阿里烏斯派）在西方采取報(bào)復(fù)行動(dòng)，以至于教皇約翰一世感到震驚。525年，在狄奧多里克的要求下，教皇前往君士坦丁堡，要求撤銷對(duì)阿里烏斯人的法令并恢復(fù)他們的教堂。他在君士坦丁堡受到了極大的歡迎。人們朝他的方向走了十二英里，拿著蠟燭和十字架。查士丁一世在他面前俯伏，想用他的手加冕。牧首伊庇法尼烏斯邀請(qǐng)他在復(fù)活節(jié)用拉丁語慶祝彌撒，他做到了，并非沒有從雙聯(lián)畫中刪掉亞歷山大族長提摩太的名字，而他早在迦克墩公會(huì)議

531年，羅馬和君士坦丁堡之間的爭端因拉里薩都主教斯蒂芬向教皇博尼法斯二世提出上訴而重新爆發(fā)，反對(duì)對(duì)埃皮法尼烏斯的判決。但他的上訴沒有被聽取，斯蒂芬提出了申請(qǐng)。