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蟻景網(wǎng)安滲透測試工程師班2023

2023-04-01 13:47 作者:曉玲581  | 我要投稿

最后得到clean Data,用于后續(xù)分析,如SNV calling


對germline變異,現(xiàn)在最常用的是GATK的best practice流程。如果是癌癥樣本,GATK有對應的流程,也有其他的軟件,如Varscan等,不在本文討論范圍內(nèi)。


04 SNV calling

04-1 數(shù)據(jù)預處理: map, sort, mark duplicates, base recalibration

給參考基因組建立索引

#create index


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