目錄

一、軟件安裝

1.AutoDock

2.AutoDockTools

3.Python

4.Python Extension Packages

5.Open Babel

二、準備程序文件

三、準備蛋白文件

1.PDB下載蛋白文件

2.PyMOL去除水和溶劑分子

3.AutoDockTools加全氫

四、準備藥物文件

1.TCMSP下載藥物文件

2. Open Babel 3D轉(zhuǎn)mol2格式

3. Open Babel 2D轉(zhuǎn)mol2格式

4.AutoDockTools加全氫、設置配體、設置扭轉(zhuǎn)鍵

五、分子對接

1.AutoGrid

2.AutoDock

六、分子對接可視化

1.分子對接整體圖

2.分子對接局部圖

七、收尾

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