蒸餾溫度低，分子蒸餾是在遠(yuǎn)低于沸點(diǎn)的溫度下進(jìn)行操作的，只要存在溫度差就可以達(dá)到分離目的，這是分子蒸餾與常規(guī)蒸餾的本質(zhì)區(qū)別。
2. 蒸餾真空度高，分子蒸餾裝置其內(nèi)部可以獲得很高的真空度，通常分子蒸餾在很低的壓強(qiáng)下進(jìn)行操作，因此物料不易氧化受損。
3. 蒸餾液膜薄，傳熱效率高。
4. 物料受熱時(shí)間短，受加熱的液面與加冷凝面之間的距離小于輕分子的平均自由程，所以由液面逸出的輕分子幾乎未經(jīng)碰撞就達(dá)到冷凝面。因此，蒸餾物料受熱時(shí)間短，在蒸餾溫度下停留時(shí)間一般幾秒至幾十秒之間，減少了物料熱分解的機(jī)會(huì)。
5. 分離程度更高，分子蒸餾能分離常規(guī)不易分開的物質(zhì)
6. 沒有沸騰鼓泡現(xiàn)象，分子蒸餾是液層表面上的自由蒸發(fā)，在低壓力下進(jìn)行，液體中無溶解的空氣，因此在蒸餾過程中不能使整個(gè)液體沸騰，沒有鼓泡現(xiàn)象。
7. 無毒、無害、無污染、無殘留，可得到純凈安全的產(chǎn)物，且操作工藝簡單，設(shè)備少。分子蒸餾技術(shù)能分離常規(guī)蒸餾不易分離的物質(zhì)。

8. 分子蒸餾設(shè)備價(jià)格昂貴，分子蒸餾裝置必須保證體系壓力達(dá)到的高真空度，對材料密封要求較高，且蒸發(fā)面和冷凝面之間的距離要適中，設(shè)備加工難度大，造價(jià)高。
9. 產(chǎn)品耗能小，由于分子蒸餾整個(gè)分離過熱損失少，且由于分子蒸餾裝置獨(dú)特的結(jié)構(gòu)形式，內(nèi)部壓強(qiáng)極低，內(nèi)部阻力遠(yuǎn)比常規(guī)蒸餾小，因而可大大節(jié)省能耗。 從分子蒸餾技術(shù)以上的特點(diǎn)可知，它在實(shí)際工業(yè)化的應(yīng)用中比常規(guī)蒸餾技術(shù)具有以下明顯的優(yōu)勢：
（1）對于高沸點(diǎn)、熱敏及易氧化物料的分離，分子蒸餾提供了*佳分離方法。因?yàn)榉肿诱麴s在遠(yuǎn)低于物料沸點(diǎn)的溫度下操作，而且物料停留時(shí)間短；
（2）分子蒸餾可極有效地脫除液體中的物質(zhì)如有機(jī)溶劑、臭味等，這對于采用溶劑萃取后液體的脫溶是*常有效的方法；
（3）分子蒸餾可有選擇地蒸出目的產(chǎn)物，去除其它雜質(zhì)，通過多級(jí)分離可同時(shí)分離2種以上的物質(zhì)；
（4）分子蒸餾的分餾過程是物理過程，因而可很好地保護(hù)被分離物質(zhì)不受污染和侵害。