單克隆抗體是由單一B淋巴細(xì)胞克隆產(chǎn)生的高度均一且只特異性識(shí)別并結(jié)合某一抗原的免疫球蛋白，其與普通的抗體一樣都由兩條較短、分子質(zhì)量較小的輕鏈（L鏈）和兩條較長(zhǎng)、分子質(zhì)量較大的重鏈（H鏈）組成。L鏈和H鏈都包含氨基酸序列變化較大的可變區(qū)（V區(qū)）和氨基酸序列相對(duì)穩(wěn)定的恒定區(qū)（C區(qū)）。在V區(qū)內(nèi)存在一些氨基酸序列十分容易發(fā)生變異的區(qū)域，稱(chēng)之為高變區(qū)（HVR）或抗原互補(bǔ)決定區(qū)（CDR），CDR是整個(gè)抗體的核心序列，也是抗體發(fā)揮生物學(xué)功能的基礎(chǔ)，它決定了該抗體結(jié)合相應(yīng)抗原的特異性，因此，對(duì)其進(jìn)行序列分析具有十分重要的意義。

目前常用的單克隆抗體CDR區(qū)域序列分析方法包括質(zhì)譜法和基于PCR擴(kuò)增等的方法。質(zhì)譜法利用質(zhì)譜儀檢測(cè)多重酶切后得到的肽段，先確定每個(gè)肽段分子的氨基酸序列，再通過(guò)序列拼接得到整個(gè)CDR區(qū)域的氨基酸序列?；赑CR擴(kuò)增的測(cè)序方法則是通過(guò)測(cè)定編碼單克隆抗體CDR區(qū)域的DNA序列間接實(shí)現(xiàn)的，其操作過(guò)程比較復(fù)雜，需要提取雜交瘤細(xì)胞的總mRNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄得到cDNA，再設(shè)計(jì)CDR序列的兼并引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增得到編碼CDR序列的DNA序列，最后再進(jìn)行DNA序列的分析。