(1)提高經(jīng)濟(jì)作物產(chǎn)量、改善作物品質(zhì)。生物有機(jī)肥營養(yǎng)物質(zhì)可以釋放發(fā)展緩慢，氮素多以銨根離子或氨基酸形式供給植物，進(jìn)入一個植物組織細(xì)胞后無需消耗企業(yè)大量能量，直接投資參與其中植物細(xì)胞活性物質(zhì)的合成，所以，使用不同生物有機(jī)肥后，植物生長快，積累社會必要的成分和干物質(zhì)多，農(nóng)產(chǎn)品信息質(zhì)量好。

　　(2)提高土壤肥力和理化性質(zhì);。生物有機(jī)肥的施用不僅可以補(bǔ)充消耗的有機(jī)肥，而且可以不斷提高土壤有機(jī)質(zhì)含量。有機(jī)質(zhì)經(jīng)微生物分解后可凝結(jié)成新的腐殖質(zhì)，與土壤中的其他物質(zhì)結(jié)合形成有機(jī)-無機(jī)復(fù)合體，促進(jìn)土壤中微團(tuán)聚體的形成，從而協(xié)調(diào)土壤中水、肥、氣、熱的矛盾，改善土壤結(jié)構(gòu)，松散土壤，提高耕作性。

　　(3)調(diào)節(jié)以及微生物區(qū)系，改善我國土壤微生態(tài)系統(tǒng)。腐熟的有機(jī)肥中含有酵母菌、乳酸菌、纖維素進(jìn)行分解菌等有益影響微生物，而加有功能菌的生物有機(jī)肥還含有固氮菌、硅酸鹽細(xì)菌、溶磷菌、光合細(xì)菌和假單胞菌等一些有益菌，這些不同微生物技術(shù)除了發(fā)展具有中國產(chǎn)生需要大量使用活性化學(xué)物質(zhì)的能力外，還具有固氮、溶磷、解鉀的能力，有的企業(yè)還具有抑制植物通過根系病原菌的能力，有的學(xué)生具有明顯改善提高土壤微生態(tài)保護(hù)環(huán)境的能力。此外，生物有機(jī)肥施入土壤后，能夠有效調(diào)節(jié)社會土壤中微生物的區(qū)系組成，使土壤中的微生態(tài)系統(tǒng)設(shè)計結(jié)構(gòu)不斷發(fā)生提供有益改變。

　　(4)激活不溶性化合物，提高土壤養(yǎng)分供應(yīng)能力;。生物有機(jī)肥中含有固氮微生物，通過固氮酶的作用將空氣中的氮還原成可供作物吸收利用的成分，是作物提供氮素營養(yǎng)的重要途徑。另外，在生物有機(jī)肥中加入一定量的溶磷微生物和硅酸鹽細(xì)菌，通過與其他土壤微生物的繁殖和協(xié)同作用，分解土壤中的一些主要次生礦物質(zhì)，同時釋放這些礦物質(zhì)固定的磷、鉀等養(yǎng)分，將無效的磷、鉀轉(zhuǎn)化為作物可直接吸收和利用的有效養(yǎng)分，提高土壤的供肥能力。

　　(5)改善土壤生態(tài)，減少植物病蟲害的發(fā)生。在生物有機(jī)肥中含有多種特效菌，在微生物的生長繁殖過程中，能分泌出多種抗生素及植物生長激素，不但能抑制植物病原微生物的活動，起到防治植物病害的作用，而且能刺激作物生長，使其根系發(fā)達(dá)，促進(jìn)葉綠素、蛋白質(zhì)和核酸的合成，提高作物的抗逆性。