雙硫死亡的第一篇生信分析文章已接收!疾病分型+預后模型思路,外加單細胞數(shù)據(jù)分析,

2023年2月份提出了雙硫死亡這一新型的細胞死亡類型:

“雙硫死亡”是什么?
在葡萄糖缺乏的SLC7A11-high癌細胞中,大量積累的二硫化物分子導致肌動蛋白細胞骨架蛋白之間的異常二硫化物鍵合,干擾其組織,最終導致肌動蛋白網(wǎng)絡崩潰和細胞死亡。這種二硫化物應激誘導的全新細胞死亡方式被命名為Disulfidptosis,雙硫死亡。
遵循鐵死亡、銅死亡的發(fā)展規(guī)律,新方向剛一爆出,第一波發(fā)文肯定是生信分析!
這不,還不到2個月的時間,第一篇“雙硫死亡”的生信分析文章已經(jīng)被接收了!

而且從投稿情況看,作者在雙硫死亡提出之后的1個月內,就完成了分析內容和文章的撰寫,充分利用了生信分析“發(fā)文周期短”的優(yōu)勢,以最小投入搶發(fā)高分生信文章!
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雖然目前還沒看到這篇文章的全文內容,但是我們可以從摘要看一下大體分析內容。

(1)?作者分析了4個雙硫死亡相關基因(DRGs)在普通轉錄組和單細胞數(shù)據(jù)中的表達和突變特征;
(2)?通過一致性聚類鑒定出2個DRGs聚類,分析兩個聚類中的差異表達基因(DEGs);
(3)?利用機器學習算法選擇DEGs構建與雙硫死亡相關的預后模型(DRPS),計算風險評分。
(4)?分析高、低風險組在臨床特征、突變格局、免疫細胞浸潤和免疫治療療效預測方面的差異。構建nomogram。利用腫瘤免疫功能障礙和排斥反應(TIDE)和IMvigor 210隊列驗證了DRPS是否預測患者對免疫治療的反應。
總結分析思路屬于:基于熱點基因集進行疾病分型+預后模型思路,同時加入了單細胞數(shù)據(jù)的分析。

小云之前給大家總結了雙硫死亡的8種生信分析切入思路,其中提到了類似的分析思路:


如果想要了解這篇“雙硫死亡”的生信內容具體是如何分析的,可以參考下面這篇銅代謝的文章,分析內容大體一致:


除了這個分析思路,雙硫死亡的生信還有很多其他的角度可以切入,感興趣可以點擊文末文章鏈接,回顧一下小云之前整理的雙硫死亡8種可做的思路,新熱點紅利期千萬不要錯過,想第一波吃螃蟹的生信人抓緊上車啦?。?/span>

小伙伴們可以根據(jù)自己的發(fā)文分數(shù)、周期等等要求綜合評估,選擇合適的思路上車,想要周期短能快點發(fā)出來的,建議分析思路比較成熟的純生信思路;想要發(fā)比較高分的,建議選進階版純生信(加入了創(chuàng)新的分析內容)或干濕結合思路。不管用哪種思路,都要趁著新熱點的黃金搶發(fā)期,快快行動起來!比的就是誰更快~
