記錄原因

自己學習，怕后面忘記了，所以發(fā)在此處以記錄！

如有錯誤歡迎指正

所用軟件

SRA Toolkit、trim-galore、hisat2、samtools、subread和R。R腳本差異分析參考生信技能樹代碼（https://github.com/jmzeng1314/GEO/blob/master/airway_RNAseq/DEG_rnsseq.R）。根據(jù)你的sra文件可能需要用到fasterqc

上游分析

差異分析

得到差異基因就差不多了

參考：

https://github.com/jmzeng1314/GEO/blob/master/task1-check-specific-genes/step3-DEG.R