宋金元時(shí)期瘟疫防治理論的豐富。宋代郭雍《傷寒補(bǔ)亡論》補(bǔ)充了《傷寒論》中未能詳細(xì)論及的“時(shí)行瘟疫”，其獨(dú)到見解超于各家之上，在治疫方面提出“各因其時(shí)而治之”，主張治療瘟疫要區(qū)分時(shí)令。北宋時(shí)期運(yùn)氣學(xué)說盛行，醫(yī)家多結(jié)合運(yùn)氣學(xué)說來詮釋疫病，如《圣濟(jì)總錄》的六十年運(yùn)氣圖和南宋陳言的運(yùn)氣十六方，把運(yùn)氣學(xué)說在疫病方面的應(yīng)用推向了歷史新高。 金元時(shí)期，雖社會(huì)動(dòng)蕩變遷，但學(xué)術(shù)爭(zhēng)鳴甚為活躍，中醫(yī)學(xué)產(chǎn)生了許多流派，最具代表性的人物有劉完素、李東垣、張從正和朱震亨，史稱金元四大家。 這一時(shí)期，對(duì)各種疫病的理論和實(shí)際防治經(jīng)驗(yàn)都有了很大提高，在對(duì)前代學(xué)術(shù)繼承和發(fā)展的基礎(chǔ)上逐漸產(chǎn)生了許多新的認(rèn)識(shí)。其中劉完素針對(duì)當(dāng)時(shí)疫病流行的特點(diǎn)提出“六氣皆能化火”，以火熱病機(jī)論疫病，在其《傷寒標(biāo)本心法類萃》中專設(shè)“傳染”一卷，載有“凡傷寒疫癘之病，何以別之？蓋脈不浮者，傳染也”，并在治療上大膽創(chuàng)新，提倡重用寒涼治疫。 與劉完素同時(shí)代的張從正也對(duì)此持相同觀點(diǎn)，認(rèn)為“傷寒、溫疫、時(shí)氣、冒風(fēng)、中暑，俱四時(shí)不正之氣也”，在治療上不可皆用辛溫之劑，而要因時(shí)因地制宜，并創(chuàng)立治疫歌訣—— “人間治疫有仙方，一兩僵蠶二大黃，姜汁為丸如彈大，井花調(diào)蜜便清涼”?？傊?，張從正重視祛邪、對(duì)汗、吐、下三法的運(yùn)用具有獨(dú)到見解。 李東垣以“氣虛陰火”論病機(jī)，“內(nèi)傷熱中”辨疫證，“甘溫除熱” 治疫病，創(chuàng)立了補(bǔ)土論，并創(chuàng)制了補(bǔ)中益氣湯，為后世樹立了扶正以祛邪的典范。朱丹溪發(fā)展了相火論，提倡治療中多用滋陰之法。王好古《陰證略例》集陰證論之大成，完善了疫病的陰證學(xué)說。這些均為疫病學(xué)說理論體系的豐富和發(fā)展起到重要的推動(dòng)作用。