什么是質粒圖譜

質粒圖是質粒的圖形表示，它顯示了質粒的主要地標或元素的位置。質粒中元素的相對位置可以通過限制性映射來識別。限制性圖譜是特定質粒內限制性識別位點的圖譜。因此，它參與限制性內切酶對質粒的消化。限制映射如圖 1 所示。

圖 1：限制映射

在限制映射中可以使用兩種方法：

1.限制性酶切：

• 用一種或兩種限制性內切酶限制性酶對質粒進行限制性酶切化

• 根據(jù)質粒產(chǎn)生的片段大小映射質粒

2.測序：

• 對整個質粒進行測序

• 鑒定質粒的元素

如何讀取質粒圖譜

圖2：質粒圖

質粒圖譜的讀取主要集中在質粒的特征上。他們是：

1. 質粒的名稱和大小

• 質粒的名稱和大小在圓形質粒的中間標明。
  

2. 質粒的元素 –

• 復制起源 – 通過招募細菌轉錄機制參與啟動復制的DNA序列。
  

• 抗生素抗性基因 – 允許在選擇性培養(yǎng)基中選擇含質粒的細菌。

• 多個克隆位點 – 由多個限制性識別位點組成的短序列，用于插入外源 DNA 片段

• 插入 – 插入到質粒中的目的基因

• 啟動子區(qū)域 – 轉錄過程中 RNA 聚合酶的結合位點

• 可選標記 – 允許選擇插入基因的成功表達

• 引物結合位點 – 用作質粒 PCR 擴增以進行測序的起始位點

3. 質粒中元素的相對位置

• 質粒元件的相對位置通過限制性定位或測序進行映射。
  

4. 發(fā)起人的方向

質粒內啟動子的取向對于確定質粒中所有其他元素的取向非常重要，尤其是插入基因的取向。轉錄在啟動子的3′末端啟動。因此，基因應該處于正確的方向才能表達。

結論

通過了解質粒圖的特征，例如質粒的名稱和大小，質粒中元素的類型及其相對位置以及啟動子的方向，可以讀取質粒圖。