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PROTAC Linker |蛋白降解靶向嵌合體連接器| E3連接酶配體-linker偶聯(lián)物

2023-02-09 10:28 作者:碳水科技-Tanshtech  | 我要投稿

PROTAC 全稱為 proteolysis-targeting chimeras (蛋白水解靶向嵌合分子),是一種雜合雙功能小分子化合物,PROTAC 分子一般由三部分組成:靶蛋白配體、連接子 Linker 以及 E3 蛋白連接酶配體。

E3 蛋白連接酶是引起靶蛋白泛素化的關(guān)鍵結(jié)構(gòu),它的配體包括諸多種類,CRBN (Cereblon)、VHL (von Hippel-Lindau)、IAP 及 MDM2 等為目前常見類別。在選擇上一般 CRBN 度胺類配體,其次是 VHL 及 IAP 等由內(nèi)源性配體肽段的衍生結(jié)構(gòu)。需考慮具體的靶標(biāo)蛋白所在細(xì)胞中相應(yīng) E3 連接酶的豐度以及 PROTAC 的理化性質(zhì)參數(shù)

連接子Linker是連接 E3 連接酶配體和靶蛋白配體的化學(xué)分子。連接子的性質(zhì)對(duì) PROTAC 的通透性、分布均有很大的影響。理想的連接子長(zhǎng)度應(yīng)能在空間上既不影響兩個(gè)蛋白結(jié)合又能維持它們的結(jié)合。目前還有將連接子改造成多接頭、光轉(zhuǎn)換接頭的研究。

靶蛋白配體作為 PROTAC 的導(dǎo)向基團(tuán),負(fù)責(zé)對(duì)靶蛋白的捕獲,因而需要有較高的配位能力與選擇性。在實(shí)際應(yīng)用中,蛋白質(zhì)已有激動(dòng)劑均可以作為配體候選,而無相關(guān)分子報(bào)道的蛋白則可采用高通量篩選與虛擬篩選等方式尋找配體,并不要求配體與蛋白是抑制性或競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合,但需對(duì)靶蛋白具有較高專一性。

PROTAC降解靶蛋白是通過泛素蛋白酶體系統(tǒng)(UPS)實(shí)現(xiàn)的,其大致過程如下,PROTAC分子結(jié)合靶蛋白(POI)和E3連接酶,形成三元復(fù)合物,給靶蛋白打上泛素化的標(biāo)簽,泛素化的蛋白被細(xì)胞內(nèi)的蛋白酶體26S識(shí)別并降解。


碳水科技(Tanshtech)專注于PROTAC Linker的研發(fā),提供具有各種活性基團(tuán)的高純度PEG linker,E3連接酶配體-linker偶聯(lián)物,歡迎廣大朋友與我們溝通交流!


碳水科技(Tanshtech)提供的部分PROTAC Linker/ E3連接酶配體-linker偶聯(lián)物:

沙利度胺Thalidomide -PEG linker

Thalidomide-O-PEGn-amine

Thalidomide-O-amido-PEG4-NH2


泊馬度胺Pomalidomide-PEG linker

Pomalidomide-PEGn-amine/COOH/SH/N3/CHO/Tos/Ms/Alkyne/ piperazine

Pomalidomide-NH-PEG4-amine/COOH/SH/N3/CHO/Tos/Ms/Alkyne/ piperazine


(S,R,S)-AHPC-PEG linker

(S,R,S)-AHPC-PEGn-Alkyne/Azide/NH2/SH

(S,R,S)-AHPC-PEG4-Alkyne/Azide/NH2/SH


Diketone-PEG linker

Diketone-PEGn-PFP ester/Biotin/DBCO/Diketone

Diketone-PEG4-PFP ester/Biotin/DBCO/Diketone


AZD-PEGn- linker

AZD-PEGn-Acid/ Methyl ester/PFP/Azide

AZD-PEG4-Acid/ Methyl ester/PFP/Azide



PEG Linkers

N3-PEG3-CH2CH2COOH? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1056024-94-2

Bis-PEG9-acid? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?? ?1268488-70-5

Amino-PEG4-CH2COOH

Boc-NH-PEG2-CH2CH2COOH? ? ? ? ? ? ? ? ?1365655-91-9

NH2-PEG2-C2-Boc? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 756525-95-8

Amino-PEG4-alcohol

Amino-PEG4-CH2COOH

Amino-PEG4-alcoho? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?l86770-74-3

NH2-PEG3-COOH

NH2-PEG2-COOH

DBCO-PEG12-PA

COOH-PEG6-COOH




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