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結(jié)構(gòu)生物化學(xué)【6】

2023-06-17 10:14 作者:FY-Dieu  | 我要投稿

第十六章? ? 脂質(zhì)和生物膜

第一節(jié)? 脂質(zhì)的化學(xué)結(jié)構(gòu)和功能

1.簡單脂

特指游離的脂肪酸(FFA)以及有力的脂肪酸和醇形成的酯(包括脂肪【三酰甘油】和蠟)

飽和脂肪酸:豆蔻酸、軟脂酸、硬脂酸和花生酸。不飽和脂肪酸:油酸、亞油酸、亞麻酸和花生四烯酸。

除了亞油酸(合成花生四烯酸的前體,花生四烯酸是多種前列腺素合成的前體)和亞麻酸(是二十二碳六烯酸和二十碳五烯酸合成的前體)是必需脂肪酸

(1)脂肪

脂肪的生理功能是貯存能量,一般貯存在脂肪細(xì)胞中,與膽固醇酯或其他的固醇酯一起以脂滴的形式存在。脂滴外部還有一層脂外被蛋白(PLIN),是一層保護(hù)性結(jié)構(gòu),阻止脂肪酶對脂肪的水解(可被蛋白激酶A【PKA】激活,磷酸化,失去活性,暴露內(nèi)部的脂滴)

脂肪氧化只能在有氧的條件下進(jìn)行

(2)蠟

由長鏈脂肪酸和高級脂肪酸形成的酯,起保護(hù)和防水的作用

2.復(fù)合脂(除了含有脂?;痛蓟鶊F(tuán)以外,還含有一些非脂成分)

(1)甘油磷酸

包括磷脂酰膽堿(PC,卵磷脂)、磷脂酰絲胺酸(PS)、磷脂酰肌醇(PI)、磷脂酰乙醇胺(PE)二磷脂酰甘油(心磷脂)

(2)鞘磷脂

兩性分子,結(jié)構(gòu)和磷脂類似。神經(jīng)組織中含量高,尤其是髓鞘

(3)糖脂

糖類通過半縮醛羥基與脂質(zhì)以糖苷鍵相連,包括鞘糖脂(脂質(zhì)部分是神經(jīng)酰胺)和甘油糖脂(脂質(zhì)部分是二酰甘油【DG】)

3.異戊二烯類脂質(zhì)

包括萜、脂溶性維生素和類固醇

(1)萜

由數(shù)個異戊二烯單位連接而成,頭尾相接

是出色的抗氧化劑

(2)類固醇

膽固醇:只有位于三號位的羥基是親水的,其余部分是完全疏水的(是一種疏水更強(qiáng)的兩性脂),是許多物質(zhì)的前體

麥角固醇,豆固醇

(3)脂溶性維生素

第二節(jié)? 生物膜的結(jié)構(gòu)和功能(具體見細(xì)胞生物學(xué)筆記)

第三節(jié)? 物質(zhì)的跨膜運(yùn)輸(具體見細(xì)胞生物學(xué)筆記)



第十七章? ? 激素及其受體的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)

第一節(jié)? 激素的一般性質(zhì)

1.激素的定義

是一類非營養(yǎng)的、微量就可以起作用的在細(xì)胞間傳遞信息的化學(xué)物質(zhì)

分泌激素的細(xì)胞稱為內(nèi)分泌細(xì)胞,受激素作用的細(xì)胞叫做靶細(xì)胞

根據(jù)激素作用的范圍,可分為:

(1)內(nèi)分泌激素:此類激素離靶細(xì)胞較遠(yuǎn)

(2)神經(jīng)內(nèi)分泌激素:有某些特化的神經(jīng)細(xì)胞(神經(jīng)內(nèi)分泌細(xì)胞)分泌,經(jīng)過血液循環(huán)或通過局部擴(kuò)散到達(dá)作用的靶細(xì)胞(如催產(chǎn)素和抗利尿激素)

(3)旁分泌激素:只作用于臨近細(xì)胞(如前列腺素、阿片肽以及一些多肽生長因子)

(4)自分泌激素:作用于原來分泌它的細(xì)胞(如刺激T細(xì)胞分裂的白細(xì)胞介素-2、某一些生長因子以及某些原癌基因的產(chǎn)物

(5)內(nèi)部分泌激素:在細(xì)胞內(nèi)分泌后,留在原來細(xì)胞中起作用(信號定位序列)

2.激素的化學(xué)本質(zhì)、分類和生物合成

肽類或蛋白質(zhì);固醇類激素(均衍生于膽固醇,具有相似的核心環(huán)結(jié)構(gòu),表面的二維結(jié)構(gòu)相似,化學(xué)性質(zhì)的差異取決于空間的取向和側(cè)鏈的大?。?;氨基酸衍生物(衍生于特定的氨基酸,如色氨酸【5-羥色胺和褪黑素】和酪氨酸【腎上腺素和去甲腎上腺素】);脂肪酸衍生物(衍生于花生四烯酸的有前列腺素、凝血惡烷和白三烯)

按照溶解性質(zhì)來分,可以分為:水溶性激素和脂溶性激素。兩者差別有:(1)脂溶性激素很容易的就通過生物膜,難以儲存在細(xì)胞內(nèi),需要時才合成釋放(甲狀腺素除外)。水溶性激素可以被包被在囊泡中,需要時就可以直接釋放。(2)脂溶性激素難溶于水,在血液中與特殊的蛋白質(zhì)相結(jié)合才可以轉(zhuǎn)運(yùn)。絕大多數(shù)水溶性激素轉(zhuǎn)運(yùn)不需要與血清蛋白結(jié)合,容易被代謝掉。(3)脂溶性激素的疏水性使它們可以直接穿過生物膜,與胞內(nèi)的受體結(jié)合,產(chǎn)生細(xì)胞的內(nèi)效應(yīng)。水溶性激素?zé)o法直接通過質(zhì)膜,需要和細(xì)胞膜上的受體結(jié)合才可以發(fā)揮作用

肽類和蛋白質(zhì)激素以前體的方式被合成(前激素原),在N端有指導(dǎo)其進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的信號序列(在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中切除,成為激素原)和原序列(在高爾基體中切除,成為有功能的激素)

3.激素的定量

放射免疫法(RIA):

RIA具有高度的特異性(來自于抗原【Ag】和抗體【Ab】之間高度專一性的可逆性結(jié)合)和極高的靈敏度(來自于放射性同位素的引入)

部分抗原(激素)被放射性標(biāo)記,被標(biāo)記的和未被標(biāo)記的與抗體(受體)的親和性相同。開始加入的抗原(全帶有放射性)與抗體結(jié)合形成的抗原-抗體復(fù)合體全部帶有放射性。之后加入未被標(biāo)記的抗原,二者會進(jìn)行競爭,最后進(jìn)行測量,并反復(fù)實驗。

最后以(沒有標(biāo)記+同位素標(biāo)記)為橫坐標(biāo),(與抗體結(jié)合的同位素標(biāo)記的)/(游離的同位素標(biāo)記的激素)為縱坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線

第二節(jié)? 激素作用的一般特征

1.特異性(一種激素只有在與其專一性受體分子相結(jié)合后才能發(fā)揮作用)

(1)受體的基本概念

可以識別并結(jié)合源自于細(xì)胞外的各種信號配體

形成可逆的二元復(fù)合物,由此引發(fā)特定的生物學(xué)效應(yīng)

(2)受體的基本性質(zhì)(至少具備一種)

【1】與配體結(jié)合的高度專一性(相對的,如同工受體每一種受體都有不同的效應(yīng))

【2】與配體結(jié)合的可逆性(有利于激素的終止)

【3】與配體結(jié)合的高度親和性

【4】與配體結(jié)合可以產(chǎn)生強(qiáng)大的生物學(xué)效應(yīng)(激素與受體結(jié)合后形成二元復(fù)合物,由此啟動信號轉(zhuǎn)導(dǎo),最終使靶細(xì)胞產(chǎn)生強(qiáng)大的生物學(xué)效應(yīng))

【5】與配體結(jié)合的飽和性

(類似于米氏酶)

(3)受體的分類和結(jié)構(gòu)

【1】細(xì)胞膜受體

都屬于膜內(nèi)在蛋白,疏水區(qū)深陷在細(xì)胞膜之中(需要用去垢劑進(jìn)行分離)

? 1)G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)

有標(biāo)志性的7次跨膜結(jié)構(gòu),每一個跨膜肽段都是疏水的α螺旋,其功能與G蛋白緊密偶聯(lián)

? 2)離子通道受體

允許離子或阻止離子進(jìn)出細(xì)胞,平時處于關(guān)閉狀態(tài),受到特定信號刺激后會開放

有三種類型的離子通道:電位門控的離子通道,打開此類通道的信號有膜電位的變化;第二信使門控的離子通道,打開此類通道的信號只能是第二信使,如cGMP和cAMP;配體門控的離子信道,只有此類信道才是激素受體,打開它的信號是與配體結(jié)合

? 3)酶受體

在本身是受體時,兼有酶的活性(如心房利鈉肽受體【鳥苷酸環(huán)化酶活性】、胰島素和轉(zhuǎn)化生長因子β受體【分別具有酪氨酸蛋白激酶和絲氨酸蛋白激酶的活性】、白細(xì)胞共同抗原CD45受體【具有蛋白質(zhì)酪氨酸激酶的活性】)。激素相當(dāng)是這些酶的別構(gòu)激活劑

? 4)無酶活性但直接與細(xì)胞質(zhì)內(nèi)酪氨酸蛋白激酶相聯(lián)系的受體

【2】細(xì)胞內(nèi)受體

包括細(xì)胞質(zhì)受體和細(xì)胞核受體

細(xì)胞內(nèi)受體至少包括4個活性部位:一個活性部位負(fù)責(zé)與激素結(jié)合;另一個活性部位負(fù)責(zé)與DNA上特殊的堿基相結(jié)合(激素應(yīng)答原件,HRE);第三個結(jié)構(gòu)域負(fù)責(zé)讓受體之間形成二聚體,結(jié)合HRE的部位有特殊的活動模體(鋅指結(jié)構(gòu));第四個結(jié)構(gòu)域負(fù)責(zé)激活(或抑制)基因的轉(zhuǎn)錄

如果是細(xì)胞質(zhì)受體,則還有第五個活性部位:在無刺激時,該部位與HSP90或HSP70結(jié)合,?

2.高效性

3.可能需要第二信使(例如cAMP、cGMP、1,4,5-三磷酸肌醇(IP3)、鈣離子和二酰甘油

4.脫敏性

與激素長時間接觸時,靶細(xì)胞傾向于降低其反應(yīng)性

5.時效性

6.可能產(chǎn)生快反應(yīng)或慢反應(yīng)

第三節(jié)? 激素作用的詳細(xì)機(jī)制

1.脂溶性激素的作用機(jī)制

脂溶性激素進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)之后,與細(xì)胞質(zhì)受體結(jié)合,將細(xì)胞質(zhì)受體上的HSP90、HSP70、IP釋放,細(xì)胞質(zhì)受體上的HRE和核定位信號(NLS)暴露出來。再NLS的指導(dǎo)下,激素和受體的二元復(fù)合物進(jìn)入細(xì)胞核,在鋅脂模體結(jié)構(gòu)與DNA分子上高度特異性的HRE結(jié)合,再通過受體上激活基因轉(zhuǎn)錄的結(jié)構(gòu)域?qū)⒔M蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HAT)招募進(jìn)來,催化組蛋白乙?;?,使局部染色質(zhì)便松散

2.水溶性激素

(1)與G蛋白相偶聯(lián)的受體系統(tǒng)

G蛋白就是鳥苷酸結(jié)合蛋白,在系統(tǒng)中作為中間接受體

總共可以分為兩類:

【1】異源三聚體G蛋白

是由αβγ三個亞基所組成,是一種脂錨定蛋白。α亞基通過豆蔻酰鏈接在細(xì)胞膜上,可以結(jié)合激素的受體、腺苷酸環(huán)化酶和GTP,還有緩慢的GTP酶的活性,可以接受霍亂毒素的催化;β亞基有有β螺旋槳的結(jié)構(gòu),在結(jié)構(gòu)上穩(wěn)定α亞基β亞基的結(jié)合;γ亞基通常與β亞基形成復(fù)合物


【2】小G蛋白

只有一條肽鏈組成,結(jié)構(gòu)上類似于三聚體G蛋白的α亞基主要包括六類:Ras蛋白(參與許多生長因子的信號轉(zhuǎn)導(dǎo));Ran(幫助蛋白質(zhì)進(jìn)出細(xì)胞核);Rab蛋白(參與真核細(xì)胞內(nèi)小泡的定向和融合);ARF(參與形成小泡外被體);Rho(調(diào)節(jié)肌動蛋白細(xì)胞骨架);參與蛋白質(zhì)合成的某些起始因子和終止因子

所有的G蛋白都有兩種形式:與GDP結(jié)合的無活性形式(α亞基同βγ復(fù)合體相連接);與GTP結(jié)合的有活性形式(α亞基被激活,,單獨(dú)去激活效應(yīng)器)

大多數(shù)G蛋白依靠兩類輔助蛋白:促進(jìn)GDP/GTP再G蛋白上進(jìn)行交換交換的鳥苷酸交換因子(GEF);促進(jìn)GTP水解的GTP酶激活蛋白(GAP)

GPCR是細(xì)胞內(nèi)最常見的一類G蛋白受體(可以看作是一種特殊的GEF)可以激活靶細(xì)胞膜上特定酶的活性,或是調(diào)節(jié)特定離子通道的活性

兩個系統(tǒng):

【1】腺苷酸環(huán)化系統(tǒng)

G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)被激活后,充當(dāng)GEF,刺激細(xì)胞質(zhì)中GTP取代原來G蛋白上的GDP。α亞基被激活,與βγ復(fù)合體分離,單獨(dú)去激活細(xì)胞膜上的AC(腺苷酸環(huán)化酶)的活性。激活的AC以ATP為底物,催化cAMP(第二信使)的合成,cAMP去激活信號通路的下一個信號成分

蛋白激酶A(PKA,有兩個調(diào)節(jié)亞基【結(jié)合cAMP】,兩個激活亞基【產(chǎn)生效應(yīng)】)是一種受cAMP激活的蛋白激酶,催化ATP分子上最遠(yuǎn)的磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移到絲氨酸或蘇氨酸的羥基上。有一種A激酶錨定蛋白(AKAP)可以與調(diào)節(jié)亞基結(jié)合,將PKA限定在細(xì)胞特定的區(qū)域之中。

PKA催化的快反應(yīng): PKA的底物以糖原磷酸化酶b激酶為主,PKA對其進(jìn)行磷酸化修飾,并以激活的糖原磷酸化酶b激酶為底物,轉(zhuǎn)變成糖原磷酸化酶a(可以催化糖原的磷酸化水解)

PKA催化的慢反應(yīng):單獨(dú)的激活亞基進(jìn)入細(xì)胞核催化CRE結(jié)合蛋白(CREB)磷酸化,激活下游基因表達(dá)

【2】磷酸肌醇系統(tǒng)

通過此系統(tǒng)作用的激素有促性腺激素釋放因子(GnRH)、促甲狀腺激素釋放因子(TRF)、精氨酸加壓素(AVP)、血管緊張素II/III和腎上腺素(通過α1受體)

通過一系列激活途徑(基本同腺苷酸環(huán)化系統(tǒng),只不過cAMP變?yōu)榱姿峒〈迹?,將信號傳遞到鈣離子(第二信使)。

鈣離子可以與DG(二酰甘油)和磷脂酰絲氨酸一同激活蛋白激酶C(PKC)。PKC激活后可以進(jìn)行多種靶蛋白或酶的磷酸化修飾,其主要底物包括膜受體、膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、細(xì)胞骨架(和細(xì)胞的分泌有關(guān))和限速酶

鈣離子可以激活鈣離子傳感器,如鈣調(diào)蛋白(CAM)。鈣調(diào)蛋白可以激活很多酶(臨時作為酶的亞基);還可以激活依賴于CAM的蛋白激酶(CAMPKAII),使其發(fā)生自我磷酸化,其底物為細(xì)胞骨架

(2)酶受體系統(tǒng)

【1】受體鳥苷酸環(huán)化系統(tǒng)

該類系統(tǒng)具有潛在的鳥苷酸環(huán)化酶活性(GC),以cGMP作為第二信使(心房利鈉肽【ANP】、腦利鈉肽【BNP】、C型利鈉肽【CNP】)激活依賴于cGMP的蛋白激酶(PKG)

【2】受體酪氨酸蛋白激酶系統(tǒng)(RTK)

1)通過該系統(tǒng)發(fā)揮作用的激素除了胰島素以外,還有許多生長因子(表皮生長因子【ECF】、血小板衍生因子【PDGF】、集落刺激因子【CSF】、神經(jīng)生長因子【NGF】、類胰島素生長因子【IGF】

2)具有潛在的酪氨酸蛋白激酶的活性

3)具有高度保守的結(jié)構(gòu)(配體結(jié)合區(qū)、跨膜區(qū)、胞內(nèi)酪氨酸激酶區(qū))。當(dāng)與相應(yīng)的生長因子結(jié)合后,受體的結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,酪氨酸激酶區(qū)被激活。激酶的底物包括受體本身和細(xì)胞內(nèi)的一些其他蛋白質(zhì),當(dāng)受體本身作為底物時,導(dǎo)致受體的自我磷酸化,進(jìn)一步刺激受體所具有的酪氨酸激酶的活性,為招募含有SH2結(jié)構(gòu)域和受體結(jié)合創(chuàng)造了條件,啟動了多種蛋白質(zhì)之間的相互作用和磷酸化級聯(lián)反應(yīng)

4)一般都會激活特定的基因表達(dá)(胞外信號轉(zhuǎn)導(dǎo)到細(xì)胞核之中)

5)酪氨酸殘基的脫磷酸化有專門的蛋白質(zhì)酪氨酸磷酸酶(PTP)催化

6)與細(xì)胞的癌變有密切的關(guān)系

有關(guān)細(xì)胞癌變:

細(xì)胞的癌變是指細(xì)胞的分裂失去控制。

癌基因(存在于基因組之中的癌基因是原癌基因或細(xì)胞癌基因,存在于腫瘤細(xì)胞基因組中的癌基因被稱為病毒癌基因)正常的原癌基因在細(xì)胞中是良性的,表達(dá)產(chǎn)物起著調(diào)節(jié)和控制細(xì)胞分化的作用。當(dāng)這些基因過量表達(dá)后,將會導(dǎo)致細(xì)胞的癌變

根據(jù)表達(dá)的產(chǎn)物,原癌基因有:蛋白激酶類、生長因子類、生長因子受體類、小G蛋白類、轉(zhuǎn)錄因子類

病毒癌基因是隨著病毒感染進(jìn)入細(xì)胞的,利用宿主的表達(dá)機(jī)器進(jìn)行表達(dá)之后,直接作用于宿主細(xì)胞與細(xì)胞生長和分裂有關(guān)的信號通路,使正常信號受到干擾

(3)NO系統(tǒng)

NO的化學(xué)本質(zhì)是自由基

在體內(nèi),NO由一氧化氮合酶(NOS)合成催化產(chǎn)生,前體為L-Arg(精氨酸)

有三類的一氧化氮合酶

硝化甘油可用來治療心臟病,是因為硝化甘油可以在體內(nèi)轉(zhuǎn)變成NO,有擴(kuò)張血管的作用(舒血管)(激活鳥苷酸環(huán)化酶,再激活PKG,最后再激活鈣離子通道,

在植物中NO(通過硝酸還原酶產(chǎn)生)作為信號分子,是生長發(fā)育的調(diào)節(jié)物,作為植物抵抗不兼容的病原體,激活一些防御基因的表達(dá),導(dǎo)致蛋白發(fā)生亞硝基還原反應(yīng),與蛋白質(zhì)上的半胱氨酸巰基共價結(jié)合

3.信號的終止

(1)激素-受體二聯(lián)體的解離,受體回歸無活性狀態(tài)

(2)受體脫敏(是受體的數(shù)量減少)

(3)第二信使的降解,降解第二信使,阻止受體的繼續(xù)活化

(4)G蛋白的自我滅活

有許多的G蛋白的酶活性需要GAP的幫忙,GAP可以提高GTP的活性,從而加快G蛋白滅活的速率

霍亂是一種腸道傳染病,由霍亂弧菌引起,會產(chǎn)生一種霍亂毒素(CT,外毒素),可以修飾Gs蛋白被修飾后,GTP酶的活性立刻消失,導(dǎo)致腺苷酸環(huán)化酶(AC)的持續(xù)環(huán)化,導(dǎo)致cGMP不斷產(chǎn)生,PKA的不斷激活,效應(yīng)不斷產(chǎn)生。

百日咳毒素(PT)可以阻止結(jié)合在活化的G蛋白α亞基上GTP與GDP的互相轉(zhuǎn)換,之后同霍亂毒素。

(5)蛋白質(zhì)的去磷酸化

催化磷酸酯鍵水解的蛋白磷酸酶(PPP),使蛋白恢復(fù)到脫磷酸化狀態(tài)

阿法替尼是一種治療非小細(xì)胞肺癌的藥物(本質(zhì)上是一些蛋白激酶的抑制劑),對過度表達(dá)的產(chǎn)物進(jìn)行不可逆性抑制

4.信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的整合

本圖來自于楊榮武的《生物化學(xué)原理》

第四節(jié) 激素調(diào)節(jié)及其反饋

長反饋:靶腺分泌的最終激素與CNS,下丘腦或腦垂體上內(nèi)源的受體結(jié)合,阻止激素從這些細(xì)胞的釋放

短反饋:腦垂體分泌的激素與下丘腦上的內(nèi)源受體結(jié)合,最終抑制下丘腦分泌激素

超短反饋:下丘腦分泌的激素抑制自身的分泌


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