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gromacs教程1-了解gromacs

2023-08-09 10:33 作者:邱新龍分子模擬小破屋  | 我要投稿


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學(xué)習(xí)gromacs能干嘛

不能幫你泡妞,不能幫你升官發(fā)財(cái)

也許可以幫你畢業(yè),發(fā)發(fā)文章

這就只是一個工具,分析一下分子間的那些事情

至于哪些事情就是你們?nèi)庋劭床坏降哪男┪⒂^的茍且之事

比如說為啥老A分子要與老B分子發(fā)生關(guān)系(分析分子間相互作用,別想歪)

是老A的哪個地方會與老B分子是屬于有較強(qiáng)的作用

老A分子身邊有幾個老B分子在身邊(分析一下配位關(guān)系?。?/p>

老A分子在水里面穩(wěn)定狀態(tài)的構(gòu)型是咋樣(搞蛋白的)

分析一下把老A這群分子分開需要多少力(分析一下力學(xué)性能)

你以為這個就結(jié)束了?

還可以分析各種構(gòu)型的分布啊,二面角等

還可以沒事加個電流來玩

.......

剩下的你就看文獻(xiàn)吧

到底學(xué)lammps還是gromacs

搞生物就學(xué)gromacs

搞材料就學(xué)lammps

搞生物材料你牛逼,你都學(xué)吧,主推學(xué)gromacs

多學(xué)一樣,多個手藝

未來你就是就是分子模擬界的手藝人

出去吹牛逼,泡妹子還是有點(diǎn)幫助的

以后你自己去搞個培訓(xùn)班/接點(diǎn)代算

是不是感覺很爽

是不是感覺瞬間達(dá)到成功人士的感覺

沒有,就別想這么多,學(xué)好一個就行了

天天想學(xué)多個軟件,做白日夢啊


到底學(xué)NAMD還是AMBER還是GROMACS

不知道

你喜歡啥用啥

想多學(xué)請自便

大爺?shù)?,我這里整理的是GROMACS手冊

你問我這個

是不是有點(diǎn)....


怎么學(xué)習(xí)gromacs這個軟件

可以先看看我是如何吹牛逼的

然后再去了解什么是分子動力學(xué)模擬

找軟件簡單案例重復(fù)操作找感覺

查找說明掌握參數(shù)基本設(shè)置

復(fù)現(xiàn)參考文獻(xiàn)案例判定是否會操作

總結(jié)問題學(xué)會提問題

找大神/看帖子不恥下問

沒事找個群去吹個牛逼,被打一頓臉,你啥都會了


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