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每日科研進(jìn)展 l 2022.06.22 l dsRNA的位置效應(yīng)對(duì)科羅拉多馬鈴薯甲蟲RNAi效率的影響

2023-08-02 16:59 作者:RNA生物農(nóng)藥  | 我要投稿


靶向β-Actin基因的dsRNA的位置效應(yīng)對(duì)科羅拉多馬鈴薯甲蟲RNAi效率的影響

害蟲的抗藥性推動(dòng)了以RNAi為基礎(chǔ)的害蟲防治新技術(shù)的發(fā)展。為了研究dsRNA的位置依賴性的影響,該文章設(shè)計(jì)了四種不同的針對(duì)科羅拉多馬鈴薯甲蟲(CPB)β-Actin基因的200 bp dsRNA,分別為dsACT200-1、dsACT200-2、dsACT200-3、dsACT200-4,以及之前研究報(bào)道的200 bp長度的dsACT200以及700 bp長度的dsACT700,分別比較它們對(duì)CPB幼蟲的殺蟲活性。

通過數(shù)據(jù)平臺(tái)預(yù)測相關(guān)的序列,每個(gè)dsRNA都含有不同數(shù)量的siRNA,dsACT200和dsACT200–2的siRNA數(shù)量相對(duì)高于其他200 bp的dsRNA。

圖 1:ACT200s有效siRNA候選的預(yù)測

用體外合成的dsRNA處理馬鈴薯葉片,隨后喂養(yǎng)CPB幼蟲時(shí),所有被測dsRNA對(duì)CPB幼蟲都有顯著的抑制作用。

圖 2:體外合成的dsACTs飼喂CPB幼蟲的RNAi效果

結(jié)合CPB幼蟲存活率、β-Actin基因表達(dá)水平和存活CPB幼蟲體重,來自同一等位基因的不同位置的dsRNA對(duì)CPB幼蟲表現(xiàn)出不同的植物保護(hù)活性,并與預(yù)測的siRNA數(shù)量和靶序列上的分布存在一定的相關(guān)性。

圖 3: RNAi 效果的生測圖片分析

這項(xiàng)研究表明,合理設(shè)計(jì)dsRNA的特定等位基因位點(diǎn)觸發(fā)靶基因沉默的RNAi效率是增強(qiáng)殺蟲活性的關(guān)鍵因素。

原文鏈接:

https://doi.org/10.1016/j.pestbp.2022.105121


每日科研進(jìn)展 l 2022.06.22 l dsRNA的位置效應(yīng)對(duì)科羅拉多馬鈴薯甲蟲RNAi效率的影響的評(píng)論 (共 條)

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