蛋白質(zhì)序列即氨基酸排列順序是蛋白質(zhì)重要的理化性質(zhì)，對蛋白質(zhì)種類鑒定以及高級結(jié)構(gòu)預(yù)測等具有重要意義。隨著生命科學(xué)技術(shù)的發(fā)展進(jìn)步，先后涌現(xiàn)出了諸多蛋白質(zhì)測序技術(shù)，可以大致將其分為質(zhì)譜法和非質(zhì)譜法，非質(zhì)譜法主要包括Sanger法、Edman降解法、二硝基氟苯法、丹磺酰氯法、肼解法以及羧肽酶法等，其中Edman降解法是最常用的非質(zhì)譜法。

質(zhì)譜法和Edman降解法都可以用于蛋白質(zhì)序列分析，但是二者在分析原理和可以測定的序列區(qū)域上具有很大的差別。Edman降解法是一種針對N末端氨基酸的測序方法，其通過三個(gè)連續(xù)的化學(xué)反應(yīng)可以切下一個(gè)N末端氨基酸殘基，并對該氨基酸進(jìn)行鑒定，然后將少了一個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)再次進(jìn)行以上操作，如此循環(huán)，每次循環(huán)鑒定一個(gè)氨基酸殘基。但是，末端修飾或封閉的氨基酸不能進(jìn)行上述化學(xué)反應(yīng)，因此，Edman降解法對N末端修飾或封閉的蛋白質(zhì)無能為力。

質(zhì)譜法利用質(zhì)譜儀采集蛋白酶切后生成的肽段母離子的碎片信息，通過鑒定各肽段的氨基酸組成和序列實(shí)現(xiàn)蛋白層面的序列分析。相比Edman降解法，質(zhì)譜法可以實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的全長序列分析，還可以用于N末端發(fā)生修飾的蛋白質(zhì)序列分析，打破了Edman降解法的局限性。此外，質(zhì)譜法還可以進(jìn)行從頭測序，為測定全新的或者沒有理論數(shù)據(jù)庫的蛋白質(zhì)序列提供了解決方法。

百泰派克生物科技采用島津公司Edman測序系統(tǒng)以及Thermo Fisher的Q ExactiveHF質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC色譜，提供基于質(zhì)譜法的蛋白質(zhì)序列分析服務(wù)技術(shù)包裹，可以對各種蛋白樣品進(jìn)行C/N末端測序、全長序列測定以及從頭測序等，歡迎免費(fèi)咨詢。