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DIA定量蛋白組學(xué)

2023-04-11 09:44 作者:百泰派克生物科技  | 我要投稿

目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究可以分為傳統(tǒng)的基于DDA的蛋白質(zhì)定量策略、基于MRM/SRM/PRM的靶向蛋白質(zhì)定量策略以及基于DIA的蛋白質(zhì)定量策略。基于DDA的蛋白質(zhì)定量策略如Label Free、iTRAQ、TMT和SILAC等利用液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)(LC-MS/MS)可以對成百上千種蛋白質(zhì)進(jìn)行檢測和相對/絕對定量,這些方法基于DDA數(shù)據(jù)依賴采集模式來采集質(zhì)譜數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)缺失較多、重復(fù)性低、定量數(shù)據(jù)不精準(zhǔn),難以檢測到低豐度的蛋白。?

基于MRM/SRM/PRM的靶向蛋白質(zhì)組學(xué)定量策略是質(zhì)譜絕對定量的金標(biāo)準(zhǔn),可以對蛋白質(zhì)進(jìn)行精確的絕對定量,但是檢測通量較低,通常只能鑒定幾十到上百個(gè)目標(biāo)蛋白,無法開展高通量的蛋白質(zhì)精確定量。?

近幾年發(fā)展起來的DIA蛋白質(zhì)組學(xué)基于全息式采集模式的質(zhì)譜技術(shù)實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的精確定量,完美的結(jié)合了DDA技術(shù)的高通量和靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)高精確的特點(diǎn),在高通量定量的基礎(chǔ)上也保證了定量結(jié)果的準(zhǔn)確性。DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)(如SWATH)將質(zhì)譜整個(gè)掃描范圍分成不同的小窗口,并對每個(gè)窗口中的全部母離子進(jìn)行循環(huán)檢測,理論上可無偏向性的獲取所有母離子的全部碎片信息,數(shù)據(jù)利用度高且重復(fù)性好,是定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的重要工具。?

百泰派克生物科技采用AB SCIEX Triple-TOF 5600 plus高分辨質(zhì)譜系統(tǒng)結(jié)合nanoLC-MS/MS納升色譜,提供高分辨率、高準(zhǔn)確度的DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)一站式服務(wù)技術(shù)包裹,您只需要將您的樣品寄給我們,我們會負(fù)責(zé)項(xiàng)目后續(xù)所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、肽段分離、質(zhì)譜分析、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)分析、生物信息學(xué)分析,歡迎免費(fèi)咨詢。?



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