夢(mèng)中情師竟在東京大學(xué)？

生物科學(xué)專攻?教授情報(bào)大揭秘

說不定“入江直樹“就是你的神仙教授

日本留學(xué) 頂尖名校

東大生物科學(xué)研究室

正在和你say hello：）

好不容易熬到日本疫情逐漸平穩(wěn)的美好局面，自2019年開始的這場(chǎng)風(fēng)波，不知燃起了多少熱血少年想要學(xué)習(xí)生物 / 醫(yī)學(xué)的心。「生物科學(xué)」，這個(gè)學(xué)科不僅和生物學(xué)完美掛鉤，還能讓你嘗遍跨專業(yè)領(lǐng)域融合的美好滋味，可以說是大學(xué)院理科考生從萬(wàn)眾競(jìng)爭(zhēng)者中脫穎而出的神仙專業(yè)。

最近給到不少文科學(xué)部以及大學(xué)院的干貨，知日自然也不能忘了留給理科同學(xué)們的福利。今兒，知日就扔給你一個(gè)可以讓你笑得合不攏嘴的大！福！利！全宇宙僅有一份的寶藏研究室大盤點(diǎn)！史無(wú)前例的東大生物科學(xué)專攻33位教授揭秘：）

01?

WHY東京大學(xué)？

東京大學(xué)，也就是人見人愛、誰(shuí)見誰(shuí)都夸的東大，是日本七所帝國(guó)大學(xué)之首的日本最高學(xué)術(shù)殿堂，也是是日本第一所以現(xiàn)代學(xué)制成立的綜合大學(xué)。作為日本文部科學(xué)省“超級(jí)國(guó)際化大學(xué)計(jì)劃”A類頂尖名校，東大也是東亞研究型大學(xué)協(xié)會(huì)、學(xué)術(shù)研究懇談會(huì)、卓越研究生院計(jì)劃、領(lǐng)先研究生院計(jì)劃的成員。

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截止今年，東大在QS世界大學(xué)排名中仍然保持前列，綜合實(shí)力穩(wěn)居日本第1位、亞洲第6名，世界排名第23名。截至2021年，東京大學(xué)已經(jīng)培養(yǎng)了12名諾貝爾獎(jiǎng)得主、6名沃爾夫獎(jiǎng)得主、1名菲爾茲獎(jiǎng)得主、16位日本首相、以及21位帝國(guó)國(guó)會(huì)議長(zhǎng)。

02

生物科學(xué)究竟玩什么？

生物科學(xué)，顯而易見，主要進(jìn)行以分子水平到細(xì)胞器、細(xì)胞、組織、器官、個(gè)體、集團(tuán)水平的各種生物現(xiàn)象為素材的教育和研究。該專攻的研究手法囊括了分子生物學(xué)、分子遺傳學(xué)、分子進(jìn)化學(xué)、生物物理學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、發(fā)育生物學(xué)、生理學(xué)、形態(tài)學(xué)、生態(tài)學(xué)、系統(tǒng)分類學(xué)、群體遺傳學(xué)等等，可以說是研究手法相當(dāng)豐富、研究?jī)?nèi)容也極其廣泛。

近年，以動(dòng)物為特征的高級(jí)結(jié)構(gòu)和功能表達(dá)機(jī)制的研究、基因?/?蛋白質(zhì)以及細(xì)胞器?/?細(xì)胞?/?組織?/?器官等相關(guān)研究、以闡明人類作為進(jìn)化產(chǎn)物的人類生物學(xué)研究、以及分子細(xì)胞個(gè)體與集團(tuán)等各階層的進(jìn)化生物學(xué)相關(guān)研究都是近年來的主要關(guān)注以及研究課題。

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生物科學(xué)專業(yè)的同學(xué)們，不僅可以選擇進(jìn)入相關(guān)工業(yè)或者醫(yī)藥等企業(yè)就職，也可以考慮進(jìn)行與生物相關(guān)的應(yīng)用研究以及管理等行業(yè)，當(dāng)然與生物相關(guān)的跨專業(yè)領(lǐng)域也是當(dāng)下以及未來的熱門之選。

03?

WHY東大的生物科學(xué)？

東京大學(xué)的生物科學(xué)專攻以本鄉(xiāng)校區(qū)的理學(xué)部1、2號(hào)館以及淺野校區(qū)的理學(xué)部3號(hào)樓為中心，并囊括了彌生校區(qū)、白金校區(qū)、柏校區(qū)、三崎臨海實(shí)驗(yàn)所、小石川和日光植物園，總共有約300名大學(xué)院生在籍。值得注意的是，在東大這個(gè)學(xué)霸聚集的神仙寶地，與生物學(xué)息息相關(guān)的教員&教授，多達(dá)3位數(shù)！而生物科學(xué)專攻的大學(xué)院學(xué)生數(shù)僅為188人，能在東大實(shí)現(xiàn)1對(duì)1教學(xué)指導(dǎo)真的不是夢(mèng)！

由于東大對(duì)于擁有跨專業(yè)背景的學(xué)生的報(bào)考持有非常開放的態(tài)度，東大的生物科學(xué)專攻可以說是現(xiàn)代生物學(xué)發(fā)展的多元以及融合的典型代表。雖然東京大學(xué)的生物科學(xué)專業(yè)于2014年由原有的生物化學(xué)專業(yè)與生物科專攻整合而成，已有7年的教學(xué)經(jīng)驗(yàn)了。雖然看起來建立時(shí)間并不是很長(zhǎng)，但有不少可以在生物科學(xué)業(yè)界視為天花板存在的教授臥虎藏龍于此。

東大的生物學(xué)專攻設(shè)置有生物化學(xué)講座、光計(jì)測(cè)生命學(xué)講座、生物學(xué)講座三個(gè)主要基干講座，專注于研究從微觀到宏觀的各種生命現(xiàn)象，鼓勵(lì)學(xué)生通過分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、生理學(xué)、生態(tài)學(xué)、基因組科學(xué)、數(shù)理統(tǒng)計(jì)學(xué)等多種多樣的方法論進(jìn)行各自的課題研究。

?生物化學(xué)講座

生物化學(xué)講座致力于通過分子、遺傳基因來理解并分析生命現(xiàn)象的普遍機(jī)制，是一個(gè)從生物學(xué)和信息科學(xué)入手、闡明生命系統(tǒng)的生物信息科學(xué)領(lǐng)域。主要的研究課題有小分子RNA對(duì)表觀遺傳基因的調(diào)節(jié)控制、腦神經(jīng)系統(tǒng)等個(gè)體形成的局部基因表達(dá)、功能以及相互作用結(jié)構(gòu)、膜輸送體、受體和酶等各種蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的發(fā)揮功能等與生物信息學(xué)以及系統(tǒng)生物學(xué)相關(guān)內(nèi)容。

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?光計(jì)測(cè)生命學(xué)講座

光計(jì)測(cè)生命學(xué)講座與生物化學(xué)講座有所不同，它涉及到最先進(jìn)的以光為主要載體所進(jìn)行研究的光生命科學(xué)。簡(jiǎn)單來說，小到核酸、蛋白質(zhì)、細(xì)胞等構(gòu)成因子，大到腦功能和行動(dòng)等高級(jí)功能控制，都將光成像、光操作、分子測(cè)量等方法論對(duì)大量數(shù)據(jù)進(jìn)行精密的觀測(cè)、開發(fā)和推進(jìn)應(yīng)用。該講座不僅與專業(yè)內(nèi)的生物化學(xué)講座、生物學(xué)講座有著緊密的合作，還和本校的物理學(xué)、化學(xué)等相關(guān)領(lǐng)域也有積極的接觸。

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?生物學(xué)講座

生物學(xué)講座聽起來和生物化學(xué)講座略有相似，但更偏向從分子小層面到細(xì)胞、組織、器官、個(gè)體、群體大層面所涉及的多樣生物現(xiàn)象入手進(jìn)行教學(xué)以及各種以人為對(duì)象的研究。該講座的研究方向也是出奇的多，分子生物學(xué)、分子遺伝學(xué)、分子進(jìn)化學(xué)、生化學(xué)、生物物理學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、生理學(xué)、形態(tài)學(xué)等都是其不可缺少的入手研究方法。

04?

說說那些寶藏研究室

· 生物化學(xué)講座分野研究室?·

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①飯野 雄一 教授?/?IINO Yuichi

研究方向：分子行動(dòng)遺伝學(xué)

??研究室鏈接

http://molecular-ethology.bs.s.u-tokyo.ac.jp/labHP/J/JTop.html

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飯野雄一教授擅長(zhǎng)利用線蟲進(jìn)行與行動(dòng)遺傳學(xué)相關(guān)的神經(jīng)系統(tǒng)構(gòu)造以及其相關(guān)機(jī)能的研究。通過對(duì)小小線蟲的分析，教授甚至可以展開到對(duì)生物的學(xué)習(xí)以及記憶結(jié)構(gòu)、感官接收等神經(jīng)系統(tǒng)相關(guān)的信息處理、“反復(fù)無(wú)常的行動(dòng)”發(fā)生機(jī)制的闡明、信息素引起的個(gè)體間相互作用與種內(nèi)、種間多樣性等復(fù)雜的課題。

近期研究發(fā)表：

2021 May. 25 Glutamate signaling from a single sensory neuron mediates experience-dependent bidirectional behavior in C. elegans., Hirofumi Sato, Hirofumi Kunitomo, Xianfeng Fei, Koichi Hashimoto, Yuichi Iino., Cell Reports. Volume 35, Issue 8, 25 May 2021, 109177DOI: 10.1016/j.celrep.2021.109177

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2021 Jan. 27 Roles of the ClC chloride channel CLH-1 in food-associated salt chemotaxis behavior of C. elegans, Chanhyun Park, Yuki Sakurai, Hirofumi Sato, Shinji Kanda, Yuichi Iino, Hirofumi Kunitomo., Elife. 2021 Jan 25;10:e55701DOI: 10.7554/eLife.55701

②濡木 理?教授?/?NUREKI Osamu

研究方向：構(gòu)造生命科學(xué)

??研究室鏈接

http://www.nurekilab.net/

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濡木理教授專注于在原子分解水平上理解各種生命現(xiàn)象。具體來說，首先學(xué)生將需要通過X射線晶體結(jié)構(gòu)的分析，來確定生物學(xué)上重要的蛋白質(zhì)?核酸的立體結(jié)構(gòu)。同時(shí)，基于由此得到的信息，建立關(guān)于功能表達(dá)機(jī)制的假設(shè)。最后，在進(jìn)行in vitro以及in vivo的變異體分析的同時(shí)驗(yàn)證假設(shè)的成立與否。目前，「非翻訳RNA関連」、「膜蛋白質(zhì)」以及「信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)與癌癥」都是該研究室的主要研究中心。

近期研究發(fā)表：

"Cryo-EM structure of the human MT1-Gi signaling complex." Okamoto HH, Miyauchi H, Inoue A, Raimondi F, Tsujimoto H, Kusakizako T, Shihoya W, Yamashita K, Suno R, Nomura N, Kobayashi T, Iwata S, Nishizawa T, Nureki O, Nat Struct Mol Biol, (2021).

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"Cryo-EM structure of the beta3-adrenergic receptor reveals the molecular basis of subtype selectivity." Nagiri C, Kobayashi K, Tomita A, Kato M, Kobayashi K, Yamashita K, Nishizawa T, Inoue A, Shihoya W, Nureki O, Mol Cell, (2021).

③塩見 美喜子?教授?/?SIOMI?Mikiko

研究方向：RNA生物學(xué)

??研究室鏈接

http://www-siomilab.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/

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對(duì)于塩見美喜子教授來說，無(wú)論是什么生物，都會(huì)在進(jìn)化的同時(shí)形成獨(dú)自的基因情報(bào)。該研究室在以果蠅為對(duì)象進(jìn)行研究同時(shí)，發(fā)現(xiàn)由20~30堿基長(zhǎng)度的“小非編碼RNA”驅(qū)動(dòng)的RNA警報(bào)素機(jī)制、在保護(hù)生殖細(xì)胞基因組信息和維持個(gè)體生殖能力方面起到的核心作用?，F(xiàn)在，哺乳動(dòng)物的生殖細(xì)胞也被列入研究對(duì)象之中，主要探討生殖組織中小分子RNA的生物合成機(jī)制、轉(zhuǎn)位子在生殖細(xì)胞中的表達(dá)抑制機(jī)制、以及小鼠生殖細(xì)胞中的表觀基因組形成過程。

近期研究發(fā)表：

Onishi R, Yamanaka S, Siomi MC.piRNA- and siRNA-mediated transcriptional repression in Drosophila, mice, and yeast: new insights and biodiversity EMBO Rep. 2021; e53062 EMBO Rep. doi: doi.org/10.15252/embr.202153062

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Chikuma S, Yamanaka S, Nakagawa S, UEDA MT, Hayabuchi H, Tokifuji Y, Kanayama M, Okamura T, Hisashi A, Yoshimura A. TRIM28 Expression on Dendritic Cells Prevents Excessive T Cell Priming by Silencing Endogenous Retrovirus J. Immunol. 2021; ji2001003 J. Immunol. doi: doi.org/10.4049/jimmunol.2001003

④黒田 真也?教授?/?KURODA Shinya

研究方向：システム生物學(xué)

??研究室鏈接

http://kurodalab.bs.s.u-tokyo.ac.jp/en/top_en/

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黒田真也教授的研究室旨在通過系統(tǒng)層面，理解多種細(xì)胞功能的生物信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)的信號(hào)機(jī)制調(diào)節(jié)。同時(shí)，鼓勵(lì)學(xué)生對(duì)各種生物學(xué)過程背后的信號(hào)網(wǎng)絡(luò)，進(jìn)行編碼與解碼的數(shù)理機(jī)制進(jìn)行研究。該研究室同時(shí)使用濕實(shí)驗(yàn)和干實(shí)驗(yàn)的方法，從系統(tǒng)生物學(xué)的角度來嘗試認(rèn)識(shí)細(xì)胞過程。目前，黒田教授研究室的主要研究課題囊括了葡萄糖代謝的貫穿組學(xué)分析、胰島素效應(yīng)的時(shí)間編碼、細(xì)胞間信號(hào)的信息理論等。

近期的研究成果

Ohashi, K., Fujii, M., Uda, S., Kubota, H., Komada, H., Sakaguchi, K., Ogawa, W. and Kuroda, S., (2018). Increase in hepatic and decrease in peripheral insulin clearance characterize abnormal temporal patterns of serum insulin in diabetic subjects. npj Systems Biology and applications. 4:14. doi:10.1038/s41540-018-0051-6

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Yugi, K., Kuroda, S., (2018). Metabolism as a signal generator across trans-omic networks at distinct time scales. Current Opinions in Systems Biology. 8: 59-66. doi: 10.1016/j.coisb.2017.12.002

⑤角田 達(dá)彥?教授?/?TSUNODA?Tatsuhiko?

研究方向：醫(yī)科學(xué)數(shù)理

??研究室鏈接

http://mesm.bs.s.u-tokyo.ac.jp/

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角田達(dá)彥教授相對(duì)其他教授來說，更加偏醫(yī)學(xué)生物，他擅長(zhǎng)通過分析生物分子的龐大數(shù)據(jù)，來解釋癌癥等疾病的免疫相關(guān)生物現(xiàn)行并探索各種疾病的克服方案以及預(yù)防疾病的干預(yù)方式。通過混合數(shù)據(jù)、圖像數(shù)據(jù)、臨床信息等方式，了解癌癥和與癌癥相關(guān)的免疫微環(huán)境之間的關(guān)系。目前，通過綜合組學(xué)分析以發(fā)現(xiàn)新的生命現(xiàn)象、綜合組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)疾病的新原因、對(duì)生物圖像和組學(xué)結(jié)構(gòu)的理解都是該研究室的主要研究課題。

近期研究發(fā)表：

Sharma A, Lysenko A, Boroevich KA, Vans E, Tsunoda T. DeepFeature: feature selection in nonimage data using convolutional neural network. Briefings in Bioinformatics. 2021 Aug 6: bbab297. doi: 10.1093/bib/bbab297. Online ahead of print.

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Murakami T, Tanaka N, Takamatsu K, Hakozaki K, Fukumoto K, Masuda T, Mikami S, Shinojima T, Kakimi K, Tsunoda T, Sawada K, Imamura T, Mizuno R, Oya M. Multiplexed single-cell pathology reveals the association of CD8 T-cell heterogeneity with prognostic outcomes in renal cell carcinoma. Cancer Immunology, Immunotherapy. 2021 Jul 14. doi: 10.1007/s00262-021-03006-2. Online ahead of print.

⑥程 久美子?教授?/?UI-TEI?Kumiko?

研究方向：ゲノム情報(bào)生物學(xué)

??研究室鏈接

http://ui-tei.rnai.jp/

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程久美子教授的研究室，擅長(zhǎng)通過基因情報(bào)等作用機(jī)序，解析RNA的各種新興機(jī)制的同時(shí)，來分析分子生物學(xué)、生化學(xué)以及細(xì)胞生物學(xué)?；蛱禺愋?、siRNA的非對(duì)稱區(qū)域特異性作用、人體基因的siRNA庫(kù)構(gòu)筑、miRNA向細(xì)胞核輸送的分子機(jī)制以及miRNA抑制機(jī)制及其定量分析都是主要研究方向。

近期研究發(fā)表：

Shiomi A, Nagao K, Yokota N, Tsuchiya M, Kato U, Juni N, Hara Y, Mori MX, Mori Y, Ui-Tei K, Murate M, Kobayashi T, Nishino Y, Miyazawa A, Yamamoto A, Suzuki R, Kaufmann S, Tanaka M, Tatsumi K, Nakabe K, Shintaku H, Yesylevsky S, Bogdanov M, UmEDA M. (2021) doi: 10.3390/genes12020271

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Kobayashi Y, Miyamoto K, Aida M, Ui-Tei K. (2021) Selection of chemical modifications in the siRNA seed region that repress off-target effect. Methods in Molecular Biology, Design and Delivery of SiRNA Therapeutics, 2282, 17-30. [PDF] doi: 10.1007/978-1-0716-1298-9_2

⑦杉村 薫?教授?/?SUGIMURA Kaoru

研究方向：多細(xì)胞秩序形成學(xué)

??研究室鏈接

http://www.koolau.info/

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杉村薫教授的研究室特別關(guān)注「在塑造身體時(shí)，細(xì)胞是如何相互推動(dòng)、拉動(dòng)并觸發(fā)組織的精確變形的？」這一問題。他鼓勵(lì)學(xué)生通過結(jié)合機(jī)械、遺傳干擾、實(shí)時(shí)成像和貝葉斯推斷等方法，研究上皮形態(tài)發(fā)生調(diào)控的物理原則。機(jī)械力對(duì)個(gè)體發(fā)育控制、哺乳動(dòng)物培養(yǎng)細(xì)胞群體模式形成、多細(xì)胞集團(tuán)力學(xué)定量手法的開發(fā)都是該研究室的重要課題。

近期研究發(fā)表：

Takeru Takagi, Tasuku Ueno, Keisuke Ikawa, Daisuke Asanuma, Yusuke Nomura, Shin-nosuke Uno, Toru Komatsu, Mako Kamiya, Kenjiro Hanaoka, Chika Okimura, Yoshiaki Iwadate, Kenzo Hirose, Tetsuo Nagano, Kaoru Sugimura, and Yasuteru Urano. Visualization and Manipulation of Actin Cytoskeleton with Small-Molecular Probes. Submitted (2020)

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Keisuke Ikawa and Kaoru Sugimura.AIP1 and cofilin ensure a resistance to tissue tension and promote directional cell rearrangement. Nature Communications 9: 3295 (2018).

⑧豊島 有?教授?/ TOYOSHIMA Yu

研究方向：システム神経科學(xué)

??研究室鏈接

https://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~toyoshimalab/

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豊島有教授是東大除了飯野雄一教授以外，另一位通過線蟲進(jìn)行生物學(xué)研究的教授。但與其不同的是，豊島有教授的著眼點(diǎn)更傾向于生物的神經(jīng)科學(xué)。豊島有教授鼓勵(lì)學(xué)生通過線蟲對(duì)周邊鹽濃度的感知反應(yīng)實(shí)驗(yàn)，解析對(duì)線蟲的行動(dòng)有抑制作用的神經(jīng)系統(tǒng)，并以此在線神經(jīng)系統(tǒng)的模型、找出其情報(bào)處理機(jī)構(gòu)的動(dòng)作原理。

近期研究發(fā)表：

Yu Toyoshima, Stephen Wu, Manami Kanamori, Hirofumi Sato, Moon Sun Jang, Suzu Oe, Yuko Murakami, Takayuki Teramoto, Chanhyun Park, Yuishi Iwasaki, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino. Neuron ID dataset facilitates neuronal annotation for whole-brain activity imaging of C. elegans. BMC BIOLOGY 18 (1).?Submitted (2020)

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Moon Sun Jang, Yu Toyoshima, Masahiro Tomioka, Hirofumi Kunitomo, Yuichi Iino. Multiple sensory neurons mediate starvation-dependent aversive navigation in Caenorhabditis elegans. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 116(37) 18673-18683 (2019).

· 光計(jì)測(cè)生命學(xué)講座?·

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①深田 吉孝?教授?/ FUKADA Yoshitaka

②小島 大輔?教授?/ KOJIMA Daisuke

研究方向：神経機(jī)能生化學(xué)

??研究室鏈接

http://www.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/fukada-lab/index-j.html

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以深田吉孝教授為主導(dǎo)人、 小島大輔為講師的研究室主要關(guān)注點(diǎn)在于對(duì)視網(wǎng)膜和大腦中樞神經(jīng)系統(tǒng)中光信號(hào)的接收、轉(zhuǎn)換和傳輸的分子機(jī)制，致力于分析分子運(yùn)動(dòng)原理中個(gè)體分子的生理機(jī)能。目前，該研究室的研究課題主要有生物鐘系統(tǒng)的分子分析、記憶形成和生物鐘功能的關(guān)聯(lián)、視網(wǎng)膜的光信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)以及大腦感光分子的功能分析。

近期研究發(fā)表：

Yohey Ogawa, Tomoya Shiraki, Yoshitaka Fukada, Daisuke Kojima. Foxq2 determines blue cone identity in zebrafish. Science advances 7 (41) eabi9784. (2021)

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Takashi Ogino, Naoya Matsunaga, Takahiro Tanaka, Tomohito Tanihara, Hideki Terajima, Hikari Yoshitane, Yoshitaka Fukada, Akito Tsuruta, Satoru Koyanagi, Shigehiro Ohdo. <?Post-transcriptional repression of circadian component CLOCK regulates cancer-stemness in murine breast cancer cells >. eLife 10 (2021)

③上村 想太郎?教授?/ UEMURA Sotaro

研究方向：1分子遺伝學(xué)

??研究室鏈接

http://www.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/uemura-lab/japanese/home_ja.html

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1分子遺伝學(xué)可能會(huì)讓很多同學(xué)感到迷惑，其實(shí)1分子指的就是單分子、單細(xì)胞。上村想太郎教授主要對(duì)分子及細(xì)胞的個(gè)體個(gè)性進(jìn)行研究。他提倡通過使用可以詳細(xì)研究單個(gè)細(xì)胞或分子的個(gè)體性的獨(dú)創(chuàng)技術(shù)，進(jìn)行疾病的個(gè)體化診斷、藥物開發(fā)、分子機(jī)制闡明等。目前研究室的主要研究方向有關(guān)于1分子可視化技術(shù)對(duì)基因的調(diào)控機(jī)制、以及通過1細(xì)胞成像技術(shù)闡明細(xì)胞功能等。

近期研究發(fā)表：

Y. Oguchi*, H. Shintaku, and S. Uemura* Development of a sequencing system for spatial decoding of DNA barcode molecules at single molecule resolution Commun. Biol., 3, 788 (2020)

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N. Nitta, T. Iino, A. Isozaki, M. Yamagishi, Y. Kitahama, S. Sakuma, Y. Suzuki, H. Tezuka, M. Oikawa, F. Arai, T. Asai, D. Deng, H. Fukuzawa, M. Hase, T. Hasunuma, T. Hayakawa, K. Hiraki, K. Hiramatsu, Y. Hoshino, M. Inaba, Y. Inoue, T. Ito, M. Kajikawa, H. Karakawa, Y. Kasai, Y. Kato, H. Kobayashi, C. Lei, S. Matsusaka, H. Mikami, A. Nakagawa, K. Numata, T. Ota, T. Sekiya, K. Shiba, Y. Shirasaki, N. Suzuki, S. Tanaka, S. Ueno, H. Watarai, T. Yamano, M. Yazawa, Y. Yonamine, D. D. Carlo, Y. Hosokawa, S. Uemura, T. Sugimura, Y. Ozeki, and K. GodaRaman image-activated cell sorting Nature Commun., 11, 3452 (2020)

④榎本 和生?教授?/ EMOTO Kazuo

⑤鈴木 郁夫 教授?/?SUZUKI Ikuo

研究方向：脳機(jī)能學(xué)

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~brain/

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榎本和生教授和鈴木郁夫教授帶領(lǐng)的研究室，致力于通過遺傳要素與環(huán)境要素對(duì)腦神經(jīng)系統(tǒng)的影響的分析，提煉出個(gè)人的個(gè)性、情感表達(dá)以及精神疾病的發(fā)展形成過程。該研究室以老鼠、果蠅和人體的ES / iPS 細(xì)胞為研究模型，通過運(yùn)用生物成像、數(shù)理建模、AI機(jī)器學(xué)習(xí)等最新方法，對(duì)腦神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的形成、發(fā)展、再生結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究。

近期研究發(fā)表：

Nao Utashiro, Claire Williams, Jay Parrish, Kazuo Emoto.?Prior activity of olfactory receptor neurons is required for proper sensory processing and behavior.?Scientific Reports; 8: 8580

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長(zhǎng)谷川恵理?北谷育子?柳學(xué)理?榎本和生，「神経突起の選択的除去メカニズム」特集：スクラップ＆ビルドで発達(dá)する脳神経回路と高次脳機(jī)能，実験醫(yī)學(xué)36號(hào): 1978-1986 (2018).

⑥東山 哲也 教授?/?HIGASHIYAMA Tetsuya

⑦吉田 大和 教授?/?YOSHIDA Yamato

研究方向：発生細(xì)胞生物學(xué)

??研究室鏈接

https://www.devcell-u-tokyo.bio/

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以東山哲也教授和吉田大和教授為首的発生細(xì)胞生物學(xué)研究室，倡導(dǎo)通過開發(fā)最佳的生物材料和創(chuàng)新的技術(shù)，來研究從廣泛的生物現(xiàn)象到高層次的生命現(xiàn)象等課題。該研究室目前的主要研究有：轉(zhuǎn)位子裝置的分子結(jié)構(gòu)和工作原理、真核生物新型細(xì)胞分裂調(diào)控分子、組蛋白操作與分析技術(shù)的開發(fā)以及化學(xué)領(lǐng)域等的不同領(lǐng)域融合研究。

近期研究發(fā)表：

Kimata Y., Kato T., Higaki T., Kurihara D., Yamada T., Segami S., Morita M.T., Maeshima M., Hasezawa S., Higashiyama T., Tasaka M. UEDA M. (2019) Polar vacuolar distribution is essential for accurate asymmetric division of Arabidopsis zygotes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 116, 2338-2343.?https://doi.org/10.1073/pnas.1814160116

?

Ohno M., Ando T., Priest D.G., Kumar V., Yoshida Y., Taniguchi Y. (2019) Sub-nucleosomal genome structure reveals distinct nucleosome folding motifs. Cell 176, 520-534.e25. https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.12.014

· 生物學(xué)講座?·

①角谷 徹仁?教授?/?KAKUTANI?Tetsuji

②稲垣 宗一?教授?/ INAGAGI Soichi

研究方向：遺伝學(xué)

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~iden/

?

角谷徹仁教授和稲垣宗一教授的這個(gè)研究室與其他的研究室有些不同，他們從植物入手，進(jìn)行遺傳學(xué)和表觀遺傳學(xué)的研究。該研究室主要使用和分裂酵母為實(shí)驗(yàn)對(duì)象，研究遺傳和表觀遺傳機(jī)制，通過遺傳學(xué)方法、基因組學(xué)和生物化學(xué)分析的相結(jié)合，對(duì)表觀基因組進(jìn)行進(jìn)一步的探究。

近期研究發(fā)表：

Inagaki S, Takahashi M, Takashima K, Oya S, Kakutani T (2021) Chromatin-based mechanisms to coordinate convergent overlapping transcription. Nature Plants 7, 295-302. Pubmed

To TK, Nishizawa Y, Inagaki S, Tarutani Y, Tominaga S, Toyoda A, Fujiyama A, Berger F, Kakutani T. (2020) RNA interference-independent reprogramming of DNA methylation in Arabidopsis. Nature Plants 6, 1455-1467. Pubmed

③久保 健雄?教授?/ KUBO Takeo

④國(guó)枝 武和 教授?/?KUNIEDA Takekazu

研究方向：細(xì)胞生理化學(xué)

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~saibou/

?

久保健雄教授和國(guó)枝武和教授主要分為3大板塊。該研究室的重點(diǎn)中的重點(diǎn)就是通過對(duì)蜜蜂社會(huì)性行動(dòng)的分子神經(jīng)基礎(chǔ)的解析，展開對(duì)大腦領(lǐng)域以及遺傳活動(dòng)的深入研究。另外，爪蟾幼生尾再生的分子機(jī)制、蝮蛇對(duì)極端環(huán)境的耐受性的分子層面的研究等也是當(dāng)下該研究室的主要課題。

近期研究發(fā)表：

Iino S, Shiota Y, Nishimura M, Asada M*, Ono, M* and Kubo T*.?(2020) Neural activity mapping of bumble bee (Bombus ignitus) brains during foraging flight using immediate early genes. Sci. Rep. in press.

Kumagai H?, KuniEDA T?, Nakamura K?, Matsumura Y?, Namiki M, Kohno H, Kubo T. (2020) Developmental stage-specific distribution and phosphorylation of Mblk-1, a transcription factor involved in ecdysteroid-signaling in the honey bee brain. Sci. Rep. in press.

⑤武田 洋幸 教授?/?TAKEDA Hiroyuki

⑥入江 直樹 教授?/?IRIE Naoki.

研究方向：動(dòng)物発生學(xué)

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~hassei/

?

武田洋幸教授和入江直樹教授（夢(mèng)中情師竟在東大？）的研究室，則使用斑馬魚等小型魚類進(jìn)行對(duì)脊椎動(dòng)物初期發(fā)生過程中的體軸形成、器官形成機(jī)制的分析。同時(shí)，研究室還加入了斑馬魚基因組計(jì)劃的深入探討，以促進(jìn)對(duì)脊椎動(dòng)物的基因組進(jìn)化的研究。目前，該研究室的主要課題有體軸形成及器官形成的基本原理、演化與發(fā)生的一般關(guān)系規(guī)律的闡明以及母嬰間微節(jié)律對(duì)母嬰發(fā)生的影響等。

近期研究發(fā)表：

Ryohei Nakamura, Yuichi Motai, Masahiko Kumagai, Candice L. Wike, Haruyo Nishiyama, Yoichiro Nakatani, Neva C. Durand, Kaori Kondo, Takashi Kondo, Tatsuya Tsukahara, Atsuko Shimada, Bradley R. Cairns, Erez Lieberman Aiden, Shinichi Morishita, Hiroyuki TakEDA, CTCF looping is established during gastrulation in mEDAka embryos. Genome Research, 31:968-980. (2021).

Candice L. Wike, Yixuan Guo, Mengyao Tan, Ryohei Nakamura, Dana Klatt Shaw, Noelia Díaz, Aneasha F. Whittaker-Tademy, Neva C. Durand, Erez Lieberman Aiden, Juan M. Vaquerizas, David Grunwald, Hiroyuki TakEDA, Bradley R. Cairns, Chromatin architecture transitions from zebrafish sperm through early embryogenesis. Genome Research, 31:981-994. (2021).

⑦塚谷 裕一 教授?/?TSUKAYA Hirokazu

研究方向：発生進(jìn)化

??研究室鏈接

https://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~bionev2/

?

塚谷裕一教授是另一位為數(shù)不多的對(duì)植物進(jìn)行展開式研究的教授。該研究室的主要關(guān)注點(diǎn)便是樹葉的發(fā)育和進(jìn)化。迄今為止，該研究室通過擬南芥確定了控制葉片形狀和大小的重要基因，可以說是領(lǐng)先于世界其他地區(qū)。同時(shí)，在塚谷教授的帶領(lǐng)下，更是發(fā)現(xiàn)了植物的補(bǔ)償作用機(jī)制。目前，該研究室著重于研究調(diào)節(jié)樹葉形態(tài)的遺傳基因群及其控制網(wǎng)絡(luò)、以及葉片自適應(yīng)形態(tài)進(jìn)化的基因背景等。

近期研究發(fā)表：

An auxin signaling network translates low-sugar-state input into compensated cell enlargement in the fugu5 cotyledonTabeta H, Watanabe S, Fukuda K, Gunji S, Asaoka M, Hirai MY, Seo M, Tsukaya H, Ferjani APLoS Genet. 2021 Aug 5;17(8):e1009674. doi: 10.1371/journal.pgen.1009674. PMID: 34351899.

Identification of the unique molecular framework of heterophylly in the amphibious plant Callitriche palustris LKoga H, Kojima M, Takebayashi Y, Sakakibara H,Tsukaya H. Plant Cell. 2021 Jul 27: koab192,?https://doi.org/10.1093/plcell/koab192

⑧近藤 修?教授?/?KONDO Osamu

研究方向：形態(tài)人類學(xué)

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~keitai/

?

近藤修教授的形態(tài)人類學(xué)，其實(shí)就是通過人體骨骼以及牙齒的形態(tài)、對(duì)人類的進(jìn)化、人類群體的變異以及適應(yīng)能力進(jìn)行展開式研究。目前，該研究室主要的研究課題有西亞尼安德特人與現(xiàn)代型智人的系統(tǒng)關(guān)系與交替、土耳其新石器時(shí)代人體的骨骼特征與墓葬、繩文人及北海道阿伊努的人類學(xué)等。

近期研究發(fā)表：

Kuwamura K. (2002) Sexual and populational difference in humeral muscle insertions between Jomon people and recent Japanese. Inter-Congress of IUAES 2002 Tokyo.

Kondo O, and Ishida H. (2003) Ontogenetic variation in the Dederiyeh Neandertal infants: Postcranial evidence. In Patterns of Growth and Development in the Genus Homo, ed. Thompson JL, Krovitz GE and Nelson AJ. Cambridge: Cambridge University Press. pp.386-411.

⑨荻原 直道 教授?/?OGIHARA Naomichi

?研究方向：人類進(jìn)化生體力學(xué)

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~ogihara/

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荻原直道教授旨在從力學(xué)的角度了解人體肌肉骨骼結(jié)構(gòu)的適應(yīng)性，在闡明人類特有的例如直立雙足和精確抓取能力等運(yùn)動(dòng)功能的演變的同時(shí)，也推動(dòng)研究肌肉骨骼疾病的預(yù)防和治療。該研究室的研究方法包括基于CT等醫(yī)學(xué)斷層圖像的三維形態(tài)分析等生物力學(xué)分析、以動(dòng)作捕捉系統(tǒng)及高速攝像機(jī)對(duì)力傳感器的運(yùn)動(dòng)分析，以及基于肌肉骨骼模型的物理運(yùn)動(dòng)的計(jì)算機(jī)模擬。

近期研究發(fā)表：

Pina, M., Kikuchi, Y., Nakatsukasa, M., Nakano, Y., Kunimatsu, Y., Ogihara, N., Shimizu, D., Takano, T., Tsujikawa, H., Ishida, H.: New femoral remains of Nacholapithecus kerioi: Implications for intraspecific variation and Miocene hominoid evolution, Journal of Human Evolution, Vol.155, 102982, (2021/6)

Chen, T-Y., Kawakami, T., Ogihara, N., Hosoda, K., Free moment induced by oblique transverse tarsal joint: investigation by constructive approach, Royal Society Open Science, Vol.8, 201947, (2021/4)

⑩太田 博樹 教授?/ OTA Hiroki

研究方向：ゲノム人類學(xué)

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~genomeanthro/

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太田博樹教授也是人類學(xué)研究的導(dǎo)師之一，但更多的是通過基因入手。通過從古老的生物遺跡中提取和純化DNA，用測(cè)序儀進(jìn)行測(cè)序。該研究室最新的一項(xiàng)成就便是繩紋人類的全基因組測(cè)序草案。此外，主要研究的課題還有古代基因組分析、少數(shù)生產(chǎn)族的基因組分析、以及人類和麩質(zhì)食物的來源和新陳代謝相關(guān)遺傳分析。

近期研究發(fā)表：

Kae Koganebuchi, Kimitoshi Sato, Kiyotaka Fujii, Toshihiro Kumabe, Kuniaki Haneji, Takashi Toma, Hajime Ishida, Keiichiro Joh, Hidenobu Soejima, Shuhei Mano, Motoyuki Ogawa, Hiroki Oota*An Analysis of the demographic history of the risk allele R4810K in RNF213 of moyamoya diseaseAnnals of Human Genetics (2021) doi:10.1111/ahg.12424

R. Schmidt*, K. Wakabayashi, D. Waku, T. Gakuhari, K. Koganebuchi, M. Ogawa, J. Karsten, M. Sokhatsky, H. Oota*Analysis of ancient human mitochondrial DNA from Verteba Cave, Ukraine: insights Into the origins and expansions of the Late Neolithic-Chalcolithic Cututeni-Tripolye Culture.Anthropological Sciences (2020) doi: 10.1537/ase.200205

?杉山 宗隆?教授?/ SUGIYAMA?Munetaka

?伊藤 恭子?教授?/ ITO Kyoko

研究方向：生體制御

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~seigyo/

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雖然杉山宗隆教授和伊藤恭子教授的研究室合并為同一個(gè)研究室，但是研究方向卻各有不同。杉山宗隆教授主要負(fù)責(zé)植物器官的形成與再生等相關(guān)分子機(jī)制；而伊藤恭子教授則主要研究產(chǎn)生植物器官和組織模式的細(xì)胞間與細(xì)胞內(nèi)的信號(hào)、以及對(duì)改變細(xì)胞發(fā)育機(jī)制基因的尋找。

近期研究發(fā)表：

Kurataka Otsuka, Akihito Mamiya, Mineko Konishi, Mamoru Nozaki, Atsuko Kinoshita, Hiroaki Tamaki, Masaki Arita, Masato Saito, Kayoko Yamamoto, Takushi Hachiya, Ko Noguchi, Takashi UEDA, Yusuke Yagi, Takehito Kobayashi, Takahiro Nakamura, Yasushi Sato, Takashi Hirayama, Munetaka Sugiyama (2021) Temperature-dependent fasciation mutants provide a link between mitochondrial RNA processing and lateral root morphogenesis. eLife. 10: e61611. (DOI 10.7554/eLife.61611)

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Ohashi-Ito, K. and Fukuda, H.Transcriptional networks regulating root vascular development. Curr. Opin. Plant. Biol., 57: 118-123.

?寺島 一郎?教授?/?TERASHIMA Ichiro

?小口 理一?教授?/?OGUCHI Riichi

研究方向：植物生態(tài)學(xué)

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~seitaipl/

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由寺島一郎教授和小口理一教授組成的研究室，旨在通過對(duì)構(gòu)成植物生產(chǎn)基礎(chǔ)的光合系統(tǒng)、呼吸系統(tǒng)、透水性等方面的解析，從分子到個(gè)體、再到生態(tài)系統(tǒng)的各個(gè)層面，對(duì)植物的環(huán)境響應(yīng)、環(huán)境適應(yīng)等能力進(jìn)行全方位的闡述，有助于在未來將要面對(duì)的高二氧化碳和變暖環(huán)境中，提高作物的生產(chǎn)力。研究對(duì)象主要有擬南芥等具有代表性的植物、水稻等主要作物、戶外生長(zhǎng)的木本植物和酵母等。

近期研究發(fā)表：

Kitagawa T, Matsumoto A, Terashima I, Uesono Y (2021) Antimalarial quinacrine and chloroquine lose their activity by decreasing cationic amphiphilic structure with a slight decrease in pH. Journal of Medicinal Chemistry (in press)

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Funayama-Noguchi S, Shibata M, Noguchi K, Terashima I (2021) Effects of root morphology, respiration and carboxylate exudation on carbon economy in two non‐mycorrhizal lupines under phosphorus deficiency. Plant, Cell and Environment 44: 598–612.?

?上島 勵(lì)?教授?/?UESHIMA Rei

研究方向：進(jìn)化系統(tǒng)學(xué)

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~keitou/lab.html

?

上島勵(lì)教授的研究室主要以軟體動(dòng)物為研究對(duì)象，通過分子生物學(xué)以及線粒體DNA基因組結(jié)構(gòu)分析等形態(tài)學(xué)方法，研究后生動(dòng)物的進(jìn)化和系統(tǒng)的分類。目前，該研究室的研究?jī)?nèi)容主要分為基于mtDNA基因組結(jié)構(gòu)的無(wú)脊椎動(dòng)物系統(tǒng)分析、陸產(chǎn)貝類的物種分化研究、以及軟體動(dòng)物的分類及分子系統(tǒng)的解析。

近期研究發(fā)表：

Ueshima, R. and Asami, T. (2003) Single gene speciation by left-right reversal. Nature 425: 679. (doi:10.1038/425679a) [Abstract and PDF]

?

Lydeard, O., Holznagel, W. E., Ueshima, R. and Kurabayashi, A. (2002) Systematic implications of extreme loss or reduction of mitochondrial LSU rRNA helical-loop structures in gastropods. Malacologia 44: 349-352.

?土松 隆志 教授?/?TSUCHIMATSU?Takashi

研究方向：植物進(jìn)化學(xué)

??研究室鏈接

https://tsuchimatsu.wordpress.com/

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土松隆志教授的研究室將“在生物中發(fā)現(xiàn)的各種巧妙機(jī)制和形式是如何進(jìn)化的”作為研究入手點(diǎn)，以植物的繁衍機(jī)制為研究對(duì)象，從而分析對(duì)生命表達(dá)形狀以及進(jìn)化有著重要影響的基因組。目前，該研究室主要進(jìn)行「基于基因組數(shù)據(jù)的植物自適應(yīng)進(jìn)化機(jī)制扽探究」「被子植物多種生殖系統(tǒng)的進(jìn)化」「接合藻類中基因組結(jié)構(gòu)和交配方式的進(jìn)化」等課題的研究。

近期研究發(fā)表：

Kurata, S., Sakaguchi, S., Mishima, H., Tsuchimatsu, T., and Ito M. (2021) Development and characterization of nuclear microsatellite markers to reveal the neutral demographic background of flower color polymorphism in Geranium thunbergii (Geraniaceae), Genes & Genetic Systems.

?

Bamba, M., Aoki, S., Kajita, T., Setoguchi H., Watano, Y., Sato, S., and Tsuchimatsu, T. (2020) Massive rhizobial genomic variation associated with partner quality in Lotus–Mesorhizobium symbiosis. FEMS Microbiology Ecology 96: fiaa202.

?

?井原 泰雄 教授?/?IHARA Yasuo

研究方向：進(jìn)化人類學(xué)

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~shinkajin/

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井原泰雄教授的強(qiáng)項(xiàng)不僅有進(jìn)化人類學(xué)，還有數(shù)理生物學(xué)。他致力于通過使用數(shù)理生物學(xué)技術(shù)、來解析與人類行為進(jìn)化相關(guān)的各種問題。該研究室主要是通過數(shù)學(xué)模型分析和計(jì)算機(jī)模擬等方法，加深對(duì)早期人類社會(huì)進(jìn)化、人屬認(rèn)知進(jìn)化和現(xiàn)代人類文化進(jìn)化的每一個(gè)理解。

近期研究發(fā)表：

Takahashi T, Ihara Y.. application of a Markovian ancestral model to the temporal and spatial dynamics of cultural evolution on a population network.?Theoretical Populatoin Biology (2021).

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Kobayashi H, Kobori O, Ihara Y, Yaguchi H, Yasuda T..?Understanding ostensive behavior in making inferences of referential intentions. Letters on Evolutionary Behavioral Science (2021).

?大橋 順?教授?/?OHASHI Jun

研究方向：ヒトゲノム多様性

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~humgendiv/

大橋順教授擅長(zhǎng)基于囊括統(tǒng)計(jì)分析、數(shù)學(xué)分析等在內(nèi)的理論研究、和與基因組多樣性分析相關(guān)的實(shí)驗(yàn)的結(jié)合，分析人類進(jìn)化史、基因型與表型之間的關(guān)系以及分子進(jìn)化機(jī)制。當(dāng)下階段，該研究室主要對(duì)自然選擇對(duì)基因組的影響、種群起源、遷移和混血過程、 傳染病和人類遺傳適應(yīng)、以及大洋洲區(qū)域的體型和脂質(zhì)代謝研究相關(guān)的多態(tài)性進(jìn)行分析和研究。

近期研究發(fā)表：

Isshiki M, Naka I, Kimura R, Nishida N, Furusawa T, Natsuhara K, Yamauchi T, Nakazawa M, Ishida T, Inaoka T, Matsumura Y, Ohtsuka R, Ohashi J. 2021. Admixture with indigenous people helps local adaptation: admixture-enabled selection in Polynesians. BMC Ecology and Evolution (in press).

?

Isshiki M, Watanabe Y, Ohashi J. 2021. Geographic variation in the polygenic score of height in Japan. Human Genetics (in press).

知日溫馨提示：

最后再嘮叨一句！生物科學(xué)這門學(xué)科，對(duì)于英語(yǔ)文獻(xiàn)閱讀和發(fā)表能力、實(shí)驗(yàn)操作與設(shè)計(jì)能力、發(fā)現(xiàn)問題并分析解決問題的能力等均有較高的要求。特別是東大這種學(xué)霸比比皆是的bao寶藏神仙地，除了良好的日語(yǔ)溝通能力，英語(yǔ)在交流和學(xué)術(shù)論文上也是無(wú)！比！重！要！

知日塾王牌生物/藥學(xué)講師

?????

于老師東京大學(xué) 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué) 博士

哈佛大學(xué) 生物學(xué) 修士

教學(xué)經(jīng)驗(yàn)6年+

輔導(dǎo)數(shù)十位學(xué)生考上東京大學(xué)等一流院校

多年輔導(dǎo)藥學(xué)、生物相關(guān)專業(yè)的課程

從知識(shí)點(diǎn)到做題技巧

都總結(jié)了自己的解題技巧

熱切希望能與學(xué)生們分享

于老師經(jīng)驗(yàn)豐富、教學(xué)成績(jī)優(yōu)異

曾輔導(dǎo)數(shù)十位學(xué)生考上東大

東醫(yī)齒等基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)王牌名校

其耐心細(xì)致的授課風(fēng)格與專業(yè)的講解

也贏得了眾多學(xué)生的喜愛

對(duì)于東大的生物科學(xué)你還有疑問？

留下評(píng)論或私信

??王牌講師、專家團(tuán)隊(duì)為你詳細(xì)解答??