多肽質(zhì)譜就是利用質(zhì)譜技術對多肽進行鑒定分析。多肽質(zhì)譜分析的原理與蛋白質(zhì)一樣，都是通過串聯(lián)質(zhì)譜進行定性或定量鑒定。經(jīng)色譜分離的多肽分子通過離子源進行離子化后，利用質(zhì)譜儀進行一級和二級質(zhì)譜檢測，根據(jù)MS1和MS2數(shù)據(jù)，如多肽離子質(zhì)荷比、質(zhì)譜圖等結合生物信息學分析，獲取多肽的氨基酸序列信息或翻譯后修飾信息，以實現(xiàn)多肽的鑒定和表征。

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