獨木成林，小果教您用genemania把少量基因做成PPI網(wǎng)絡圖
爾云間? 一個專門做科研的團隊
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PPI網(wǎng)絡圖是生信分析中的常見圖，它可以反應一些基因蛋白之間的相互關系，但一般來講，做網(wǎng)絡圖，需要足夠多的基因，正所謂獨木難成林嘛。但事無絕對，自己手里基因少，可以從數(shù)據(jù)庫里找啊，今天小果要介紹的這個網(wǎng)站，就是可以使用簡單幾個基因就可以構(gòu)建PPI網(wǎng)絡的genemania數(shù)據(jù)庫。
網(wǎng)址為http://genemania.org/
界面很簡潔，就長這樣
左上角有個人的標志，表示現(xiàn)在物種是人，可以點擊選擇更換
這里可以選擇大鼠小鼠果蠅斑馬魚等，都是一些常見的模式生物。
后面的搜索框可以寫入一些基因，這里我們可以看一下示例，點擊e.g.就出現(xiàn)了一些基因
點擊搜索，就可以查到相互作用基因并自動構(gòu)建網(wǎng)絡了。
這樣看上去有點亂。可以點擊一下左上角的圓圈標志，一鍵整理
中間的是我們輸入的基因，周圍是數(shù)據(jù)庫中預測出的結(jié)果。
左下角有個餅圖的標志，點擊可以選擇這些基因參與的功能并在途中表示出來。
這里小果就選擇了前七個，當然小伙伴們可以選擇其他的功能，要注意的是這里小果選擇了七個功能就不能再選擇了，說明是有個數(shù)上限的。但這七種功能是可以組合的。
點擊左側(cè)的三個點的標志，可以導出結(jié)果，一般我們選擇pdf就可以了。
好了，小伙伴們，今天的內(nèi)容就是這些了，小伙伴們有什么問題的話都可以來和小果分享討論啊。
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