不做實(shí)驗(yàn)也能看到的顯微圖像,HPA數(shù)據(jù)庫
爾云間? 一個(gè)專門做科研的團(tuán)隊(duì)
? ?
小伙伴們都知道顯微圖像是文章中的重要圖片,這個(gè)圖片可以為文章增色不少,但是對(duì)于小果這種只做生信分析,不做怎么做實(shí)驗(yàn)的來說,顯微圖片是有點(diǎn)難得的,所以就需要有個(gè)數(shù)據(jù)庫來根據(jù)我們得出的基因來找到對(duì)應(yīng)的顯微圖片。
HPA數(shù)據(jù)庫(Human Protein Atlas)是基于蛋白組學(xué),轉(zhuǎn)錄組學(xué)以及系統(tǒng)生物學(xué)數(shù)據(jù),可以繪制組織、細(xì)胞、器官等圖譜。不僅收錄了腫瘤組織,也涵蓋了正常組織的蛋白表達(dá)情況,而且還可以查閱腫瘤患者的生存曲線。
網(wǎng)址:https://www.proteinatlas.org

搜索基因名,小果這里用的是RPSA

上圖展示的就是搜索結(jié)果
我們選擇tissue這一欄的圖片,點(diǎn)擊后畫面如下

往下拉動(dòng)網(wǎng)頁,看到柱狀圖

這里可以選擇自己想要研究的組織,小果想要研究肺,那就點(diǎn)擊Lung

然后就能看到顯微圖片了,點(diǎn)進(jìn)去可以看到詳細(xì)信息

這里是正常的組織,如果想要看基因在癌癥組織里的顯微圖像,那就接著往下看
選擇pathology

往下拉可以看到五種癌癥中基因表達(dá)的顯微圖像

這里小果是想看肺癌和正常肺組織中基因表達(dá)圖像的差異,所以選擇肺癌,點(diǎn)進(jìn)去就可以了

這就是基因在肺癌里的蛋白顯微圖像了
好了,小伙伴們是不是覺得很簡(jiǎn)單呢,那就趕緊選一個(gè)自己感興趣的基因去搜索一下吧,小伙伴們有什么問題歡迎來和小果分享討論啊。