Label Free和iTRAQ技術(shù)都是常用的蛋白定量分析方法。它們最大的區(qū)別在于蛋白樣品酶解前是否使用標(biāo)簽進(jìn)行標(biāo)記。非標(biāo)記定量技術(shù)Label Free直接將未標(biāo)記的蛋白質(zhì)酶解成肽段進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析，然后根據(jù)質(zhì)譜數(shù)據(jù)如峰強(qiáng)度、峰面積、保留時(shí)間等結(jié)合相應(yīng)的數(shù)據(jù)分析軟件對蛋白樣品進(jìn)行定量分析。

同位素標(biāo)記相對和絕對定量技術(shù)iTRAQ是由美國AB SCIEX公司研發(fā)的一種多肽體外標(biāo)記技術(shù)。蛋白質(zhì)在進(jìn)行酶解前，利用iTRAQ標(biāo)簽進(jìn)行標(biāo)記，iTRAQ標(biāo)簽由報(bào)告基團(tuán)、平衡基團(tuán)和肽反應(yīng)基團(tuán)組成，報(bào)告基團(tuán)在整個(gè)實(shí)驗(yàn)中起著非常重要的作用，在二級質(zhì)譜時(shí)，報(bào)告基團(tuán)在二級質(zhì)譜低質(zhì)量區(qū)釋放的不同報(bào)告離子的信號強(qiáng)度即代表了相應(yīng)標(biāo)簽所標(biāo)記的多肽的相對豐度。

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供基于iTRAQ的蛋白定量服務(wù)技術(shù)包裹。