灼口綜合征的發(fā)病通常是漸進(jìn)的，沒有已知的促發(fā)因素或行為，病因極其復(fù)雜。目前認(rèn)為可能的誘發(fā)因素有局部、系統(tǒng)、精神和神經(jīng)因素等多種方面。

傳統(tǒng)的觀點(diǎn)認(rèn)為精神因素占突出位置。局部因素則包括殘根殘冠、真菌感染等；全身因素包括更年期綜合征、糖尿病、醫(yī)源性菌群失調(diào)、維生素缺乏等。目前發(fā)病機(jī)制尚不明確，更傾向于被認(rèn)為是神經(jīng)性疼痛的一種形式。

灼口綜合癥的病因目前不清楚，多數(shù)見于更年期，四十多歲的女病人中最多見。病因?qū)W研究發(fā)現(xiàn)2/3的這類病人都有焦慮、抑郁、睡眠不好的情況。