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吸附建模之基底收斂性測試

2021-04-28 14:37 作者:邁高科技  | 我要投稿


上一篇文章我們詳細(xì)闡述了吸附基底建模需要注意的相關(guān)問題,忘記了內(nèi)容的童鞋點(diǎn)擊傳送門(吸附基底建模)回顧文章,本文我們來學(xué)習(xí)如何進(jìn)行表面能收斂性,從而確定基底和真空層厚度。


一、表面能計(jì)算公式

二、建模及計(jì)算注意事項(xiàng)

三、Cu(111)面基底和真空層厚度的收斂性測試

什么是表面能


表面能是恒溫、恒壓、恒組成情況下,可逆地增加物系表面積須對物質(zhì)所做的非體積功。

簡單來說就是表面產(chǎn)生后,由于表面原子存在不飽和鍵(也叫作懸掛鍵),使得表面比體內(nèi)具有更高的勢能,稱為表面能。

表面能可以作為測試slab模型在不同基底或真空層厚度時(shí)的穩(wěn)定性判據(jù),逐漸增加slab厚度或Thickness of Vacuum后,當(dāng)表面能誤差趨近于0.001 eV,即可視為模型合理。


表面能的不同計(jì)算公式

1、固定slab模型底層原子,僅弛豫上表面兩到三層原子

公式來源DOI: 10.1039/C7NR03889E

在同一計(jì)算級別下得到如下信息


slab模型優(yōu)化后的能量(左)

slab模型單點(diǎn)能(中)

bulk模型優(yōu)化后的能量(右上)

表面能公式如下:

其中,A為表面面積(右下),n的取值需要使n*bulk模型的總原子數(shù)等于slab模型。


2、所有原子弛豫 or 固定slab模型非表面的原子,relax上、下表面的原子

公式來源DOI: 10.3390/nano10030484

在同一計(jì)算級別下得到如下信息


slab模型優(yōu)化后的能量(左)

bulk模型優(yōu)化后的能量(右上)

表面能公式如下:

其中,A為表面面積(右下),n的取值需要使n*bulk模型的總原子數(shù)等于slab模型。

本文采用此方式進(jìn)行測試。


建模注意事項(xiàng)


對于不同基底層數(shù)的收斂性測試,需要保證真空層方向的晶胞長度(注:不是真空層)一致,否則表面能會(huì)隨著基底厚度的增加而增加,導(dǎo)致無法收斂;

②真空層測試僅需要保持基底層數(shù)不變即可。



計(jì)算注意事項(xiàng)


slab模型結(jié)構(gòu)優(yōu)化過程中,要保證晶胞形狀和體積不變(ISIF=2);

②采用單胞進(jìn)行測試即可。


本例中對Cu (111)面不同基底和真空層厚度進(jìn)行了收斂性測試。

DOI: 10.1103/PhysRevB.87.245402

下表中基底層數(shù)為Cu原子層的層數(shù);

原子數(shù)代表slab模型總原子數(shù);

優(yōu)化能量為slab模型的總能量;

為了與文獻(xiàn)保持一致,A表示一個(gè)表面的原子數(shù);

Difference為當(dāng)前結(jié)構(gòu)與上一結(jié)構(gòu)表面能差。

結(jié)合圖表信息可以發(fā)現(xiàn),當(dāng)Cu (111)基底原子層層數(shù)為7時(shí),表面能收斂至0.001 eV/atom。同理,真空層厚度選擇6.3 ?即可(注:因?yàn)槲浇r(shí)需要在基底上放吸附物,所以此處真空層厚度的選擇需要加上吸附物的高度)。

相關(guān)疑問歡迎在評論區(qū)討論。

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