來源?TMR Publishing Group

作者?Traditional Medicine Research 編輯部

研究發(fā)現(xiàn)

約34種皂甙對COVID-19Mpro比羥基氯喹、氯喹和奈非那韋更有效，其中，13種皂苷對COVID-19Mpro的結(jié)合能大于10kcal/mol。

背景

2019冠狀病毒病(COVID-19)是一種呼吸道感染性疾病，首次在中國武漢發(fā)現(xiàn)，并通過傳播至全球，急需治療COVID-19的有效抗病毒藥物。但是藥物研發(fā)不能一蹴而就，奉為“人民的希望”的瑞德西韋曾是針對埃博拉病毒、研發(fā)了13年但最終無效的藥物，關(guān)于其治療新冠病毒的安全性、療效的定論還遙遙無期。

2020年4月9日，Nature加速發(fā)表了中科院上海藥物所、清華大學(xué)和上海科技大學(xué)的三位大牛蔣華良院士、饒子和院士和楊海濤研究員團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)的治療COVID-19的新靶點(diǎn)Mpro蛋白酶。

目前，草藥中的許多成分被確定為冠狀病毒病2019（COVID-19）Mpro的潛在抑制劑，其中，皂甙的主要優(yōu)點(diǎn)是保護(hù)植物免受各種病原體的攻擊。皂甙在增強(qiáng)對抗原的細(xì)胞介導(dǎo)和體液免疫應(yīng)答方面起著關(guān)鍵作用，而且發(fā)現(xiàn)皂甙對RNA和DNA病毒都具有抗病毒活性。

在這項研究中，作者篩選了多種抗COVID-19Mpro的皂苷，利用分子對接技術(shù)篩選了抗COVID-19主要蛋白酶的皂苷庫，并鑒定了基于植物的抗COVID-19藥用皂苷的臨床應(yīng)用潛力。

方法

使用AutoDock tools 1.5.6、BIOVIA Discovery Studio 2017 R2、Chimera 1.13.1和AutoDock Vina，使用6LU7 Mpro分析草藥基生物活性皂苷的文庫，以評估它們對COVID-19 Mpro的效力。以常規(guī)西藥羥氯喹、氯喹、奈非那韋為陽性對照進(jìn)行比較。

結(jié)果

獲得了60個皂苷與6lu7Mpro的結(jié)合能，其中34個皂苷對COVID-19Mpro比羥基氯喹、氯喹和奈非那韋更有效。13種皂苷對COVID-19Mpro的結(jié)合能均大于10kcal/mol，具有很高的抗COVID-19Mpro活性。

結(jié)論

需要進(jìn)一步研究所有有效皂苷對COVID-19的抗藥性。

表1 COVID-19的潛在藥物主要蛋白酶抑制劑

圖1 (A)羥氯喹、(B)氯喹、(C)奈非那韋與COVID-19主要蛋白酶活性位點(diǎn)(PDB: 6LU7)的分子對接

圖2 COVID-19主要蛋白酶與皂苷結(jié)構(gòu)的結(jié)合作用

表2 13種皂苷抗COVID-19主要蛋白酶10 kcal/mol的結(jié)合能和高相互作用

圖3 6 LU7與幾種皂苷分子對接分析

表3 27種皂苷抗COVID-19的結(jié)合能和相互作用

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引用格式

Rehan M, Shafiullah. Medicinal plant-based saponins targeting COVID-19 M pro in silico. Tradit Med Res. 2021;6(3):24. doi: 10.12032/TMR20201130210.

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