農(nóng)業(yè)農(nóng)村部南京農(nóng)業(yè)機(jī)械化研究所前身是1934年中央農(nóng)業(yè)實(shí)驗(yàn)所時(shí)期成立的病蟲機(jī)械實(shí)驗(yàn)室，1957年獨(dú)立建制，是中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院九大學(xué)科群中農(nóng)業(yè)工程學(xué)科群的主要依托單位之一，是農(nóng)業(yè)工程科研領(lǐng)域國家級(jí)研究所。建所前后發(fā)明的具有世界里程碑意義的水稻插秧機(jī)、機(jī)動(dòng)噴霧機(jī)代表了當(dāng)時(shí)我國農(nóng)業(yè)機(jī)械研制的先進(jìn)水平。

經(jīng)過80年的建設(shè)，研究所現(xiàn)占地382畝，在職職工260人，其中研究員30余人、副研究員65人。設(shè)有穗粒類收獲機(jī)械、種植機(jī)械、莖稈類收獲機(jī)械、生物質(zhì)轉(zhuǎn)化利用裝備、綠色耕作與土下果實(shí)收獲機(jī)械化、主要糧經(jīng)作物初加工裝備、植保機(jī)械、農(nóng)業(yè)機(jī)械化技術(shù)系統(tǒng)優(yōu)化與評(píng)價(jià)、主要作物智能農(nóng)機(jī)裝備與技術(shù)、果蔬茶類收獲機(jī)械、特色農(nóng)產(chǎn)品干制與加工裝備11個(gè)科研創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)。農(nóng)業(yè)農(nóng)村部現(xiàn)代農(nóng)業(yè)裝備重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部南方種子加工工程技術(shù)中心、國家植保機(jī)械質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)中心、機(jī)械工業(yè)耕作機(jī)械產(chǎn)品質(zhì)量檢測中心等掛靠研究所建設(shè)。編輯出版《中國農(nóng)機(jī)化學(xué)報(bào)》《農(nóng)業(yè)裝備與開發(fā)》《智能化農(nóng)業(yè)裝備學(xué)報(bào)》與《中國農(nóng)機(jī)化年鑒》。