今天，小編給大家安利一個可在線繪制基因染色體位置圖的工具—MapGene2Chrom簡稱MG2C。MapGene2Chrom相比Gbrowse、MapViewer等工具輸入數(shù)據(jù)格式簡單，輸出結(jié)果易于修改，且圖片格式為SVG矢量圖，具有很好的移植性，最最重要的是不用注冊、完全免費。

目前MapGene2Chrom已經(jīng)由最初的v1.0版本更新為v2.1版本，下面小編就以最新的v2.1版本演示MapGene2Chrom的使用方法。

MapGene2Chrom網(wǎng)址：http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.1/

數(shù)據(jù)準(zhǔn)備

打開網(wǎng)頁，右邊的兩個方框內(nèi)是需要輸入的數(shù)據(jù)：1.家族中基因的信息，從左到右依次為：基因的ID，基因的起始位置，基因的終止位置，該基因所在的染色體ID，最后一列是非必需的，可選擇性設(shè)置該基因ID顯示的顏色如black，blue等；2基因所在染色體的信息（注意：只需要輸入1中所有基因所在的染色體ID并集，并不需要輸入該物種所有的染色體信息），從左到右依次為：染色體ID，染色體序列的長度

準(zhǔn)備工作

可以看出一共需要輸入兩個文件，其一是gene在染色體上的位置信息，其二是染色體的長度。準(zhǔn)備這兩個input可以從UCSC 數(shù)據(jù)庫下載gtt文件，提取目標(biāo)基因的位置信息和染色體的長度信息。

UCSC：http：?//genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway

輸出結(jié)果展示

生成的圖片是默認(rèn)格式，若滿足你的要求可右鍵點擊圖片下方保存SVG格式圖片。

個性化設(shè)置

但許多時候我們還想來點不一樣的設(shè)置，網(wǎng)頁左邊的parameters setting，包含針對染色體id字體顏色，SVG的尺寸等的設(shè)置。

注意事項

MapGene2Chrom的繪圖速度較快，且操作簡單?；虻娜旧w位置圖表現(xiàn)形式簡潔明，快動手試試吧！