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RACE - cDNA末端快速擴(kuò)增

2023-03-20 16:37 作者:鮮活鮮活的每一天  | 我要投稿

RACE: rapid amplification of cDNA? ends ? ? cDNA末端快速擴(kuò)增

RACE是一種快速擴(kuò)增cDNA的5'端或3'端序列的技術(shù)

RACE有關(guān)實(shí)驗(yàn)大致流程

RACE可分為5'RACE和3'RACE,5'RACE和3'RACE是針對(duì)mRNA而言的

為獲取mRNA5'端序列的RACE稱為5'RACE? ;為獲取mRNA3'端序列的RACE稱為3'RACE


5'RACE??

注:TdT: terminal deoxynucleotidyl transferse? ? ? ?末端脫氧核糖核酸轉(zhuǎn)移酶??

這是一種在DNA3’端添加核苷酸的酶,簡稱末端轉(zhuǎn)移酶 ,與DNA聚合酶不同的是,其催化的聚合反應(yīng)不需要模板指導(dǎo),dNTP任何一種都可做為它的底物,可以形成同聚物尾巴,如下圖的poly(dC)

以此同聚物尾巴為隨機(jī)引物,與基因特異引物一起PCR,就可完成5‘端序列的擴(kuò)增。

總流程示意圖:

3'RACE

3'RACE的原理基本上等同于RT-PCR。

以oligo(dT)為引物,將mRNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,以該cDNA為模板,以基因特異性引物和oligo(dT)為引物進(jìn)行PCR。

由于oligo(dT)特異性較低,因此,反轉(zhuǎn)錄時(shí)常在oligo(dT)引物5’端添加一些附加堿基,以此附加序列及基因特異序列設(shè)計(jì)引物進(jìn)行PCR。

總結(jié)















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