DNA FISH probe?可用于通過聚合酶鏈式反應（PCR），在第一鏈cDNA的合成過程中進行間接穩(wěn)定標記。DNA FISH probe?可用作反應性位點，用于后續(xù)的反應性熒光探針的標記。DNA FISH probe 也可用于構(gòu)建反應性DNA支架。

DNA FISH探針（allylamine-dUTP）優(yōu)點：

使用allylamine-dUTP 的間接標記為 FISH 探針合成提供了直接標記中可能不存在的巨大優(yōu)勢。 一個關(guān)鍵的好處是幾乎任何含有反應性胺基的報告分子（例如 NHS）都可以與探針連接。 雖然這當然意味著生物素和其他半抗原等分子可能會結(jié)合，但在 FISH 的情況下，這意味著幾乎任何熒光分子都可以結(jié)合。 這提供了高度的靈活性，可以根據(jù)自己的喜好進行定制，而直接標記則不能。 雖然直接標記確實需要更少的步驟并且有時可能更便宜，但在核苷酸摻入方面存在重大障礙。 根據(jù)體積，預結(jié)合的熒光核苷酸可以誘導空間效應以及阻斷轉(zhuǎn)錄機制中的活性和結(jié)合位點。 另一方面，allylamine-dUTP 沒有這些相同的缺點。 在各種研究中，與未修飾的 NTP 相比，allylamine-dUTP 轉(zhuǎn)錄已被證明具有幾乎相同的轉(zhuǎn)錄效率。 當將allylamine-dUTP 探針與過量的胺反應性熒光分子偶聯(lián)時，無論選擇何種熒光染料，都可以預期高水平的熒光團摻入和一致性。