這期小編給大家介紹一篇關(guān)于線粒體亞細(xì)胞器水平的蛋白組學(xué)的研究，于本月發(fā)表于Nature Communications雜志。作者結(jié)合SILAC標(biāo)記法與質(zhì)譜鑒定的手段，研究了線粒體外膜，膜間質(zhì)，內(nèi)膜，以及線粒體基質(zhì)的四個組分的蛋白質(zhì)組學(xué)情況。作者不僅將線粒體各個組分的蛋白組進(jìn)行更為細(xì)化地區(qū)分，還發(fā)現(xiàn)了新的定位在線粒體中的蛋白，另外，還證明以往一些在線粒體中定位分析有誤的蛋白。

線粒體是一個具有雙層膜結(jié)構(gòu)包裹的細(xì)胞器，對細(xì)胞的能量代謝起著至關(guān)重要的作用。隨著多種蛋白組學(xué)分析技術(shù)的發(fā)展，目前已有許多對線粒體細(xì)胞器蛋白組學(xué)的研究，但是這些研究幾乎都沒有對線粒體亞細(xì)胞器結(jié)構(gòu)的蛋白進(jìn)行進(jìn)一步解析。并且，當(dāng)前的線粒體蛋白質(zhì)組學(xué)研究數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)信息許多來源于生物信息學(xué)預(yù)測，而沒有經(jīng)過實驗驗證，其真實性有待考證。因此，這篇文獻(xiàn)主要研究的就是線粒體在亞細(xì)胞器水平的蛋白質(zhì)組學(xué)研究。

接下來，小編就帶領(lǐng)大家一起回顧一下文章的研究結(jié)果吧。

1. 作者首先使用SILAC標(biāo)記法使兩組細(xì)胞分別帶上輕標(biāo)和重標(biāo)標(biāo)記，然后使用蔗糖梯度分離提純帶上輕標(biāo)和重標(biāo)的線粒體。接著分別使用兩種不同的方法對線粒體進(jìn)行破碎分組分：1. 超聲處理可以將線粒體分為膜蛋白（包含內(nèi)膜和外周膜蛋白）和可溶性蛋白；2. 使用pH11.5的碳酸鹽溶液處理，將線粒體分為內(nèi)膜蛋白和（外周膜＋可溶性蛋白）兩個組分。并對已知蛋白的分離分離效果進(jìn)行質(zhì)譜和western驗證。結(jié)果表明超聲和碳酸鹽破碎線粒體分離組分是可行的。

本文首次將線粒體細(xì)分成外膜，膜間質(zhì)，內(nèi)膜，基質(zhì)四個不同組分，再結(jié)合SILAC蛋白定量鑒定的方法研究不同組分中蛋白的相對豐度來得到對線粒體蛋白的空間分布進(jìn)行研究。根據(jù)研究結(jié)果，本文不僅對許多蛋白在線粒體中的亞定位進(jìn)行重新區(qū)分，驗證，并且新發(fā)現(xiàn)了206個新的線粒體蛋白。

研究結(jié)論

本文首次將線粒體細(xì)分成外膜，膜間質(zhì)，內(nèi)膜，基質(zhì)四個不同組分，再結(jié)合SILAC蛋白定量鑒定的方法研究不同組分中蛋白的相對豐度來得到對線粒體蛋白的空間分布進(jìn)行研究。根據(jù)研究結(jié)果，本文不僅對許多蛋白在線粒體中的亞定位進(jìn)行重新區(qū)分，驗證，并且新發(fā)現(xiàn)了206個新的線粒體蛋白。