SILAC蛋白組
SILAC蛋白組或SILAC定量蛋白組學(xué),是指利用SILAC技術(shù)對蛋白質(zhì)組進(jìn)行定量研究。百泰派克生物科技提供基于SILAC標(biāo)記的定量蛋白組分析服務(wù)。
SILAC
在基于質(zhì)譜(MS)的定量蛋白質(zhì)組學(xué)中,SILAC(Stable Isotope Labeling By Amino Acids In Cell Culture)是通過在細(xì)胞培養(yǎng)過程中加入穩(wěn)定同位素標(biāo)記的氨基酸對樣品進(jìn)行標(biāo)記后結(jié)合質(zhì)譜檢測,對樣品進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析的方式是一種簡單、可靠而又強(qiáng)大的方法。SILAC通過正常代謝過程對細(xì)胞蛋白進(jìn)行標(biāo)記,在新合成的蛋白質(zhì)中加入非放射性的、穩(wěn)定的含同位素的氨基酸。SILAC提供了準(zhǔn)確的相對定量,不需要任何化學(xué)衍生或操作,即可實現(xiàn)蛋白質(zhì)組學(xué)分析。SILAC屬于體內(nèi)標(biāo)記技術(shù),使樣品更接近自然狀態(tài),其標(biāo)記效率高達(dá)100%,且標(biāo)記效果穩(wěn)定,適合于全細(xì)胞蛋白分析,以及膜蛋白的鑒定和定量,每個樣本只需要幾十微克的蛋白量。
SILAC蛋白組分析
SILAC定量蛋白組分析的實驗流程是:在細(xì)胞培養(yǎng)基中加入輕、中或重型穩(wěn)定同位素標(biāo)記的必需氨基酸賴氨酸(Lys)和精氨酸(Arg),在細(xì)胞生長過程中,新合成的蛋白質(zhì)帶上穩(wěn)定同位素標(biāo)簽。培養(yǎng)一段時間后,等量混合細(xì)胞培養(yǎng)物中各類型蛋白質(zhì),酶解后進(jìn)行質(zhì)譜分析。由于質(zhì)量差異,可以在質(zhì)譜儀中區(qū)分帶有不同穩(wěn)定同位素組成的化學(xué)性質(zhì)相同的肽對。通過比較一級質(zhì)譜圖中不帶標(biāo)記和帶同位素標(biāo)記的質(zhì)譜峰型的面積大小即可進(jìn)行相對定量,同時二級譜圖還可以對肽段進(jìn)行序列測定從而進(jìn)行蛋白鑒定。
