circRNA新文速遞丨20230422
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本期關(guān)鍵詞:Sex-lethal(SXL);反向剪切;環(huán)狀RNA;性別特異性;克羅恩病;circSMAD4;結(jié)腸炎;miR-135a-5p
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一、Sex-lethal調(diào)節(jié)性別差異表達(dá)的環(huán)狀RNA的反向剪接和生成
標(biāo)題:Sex-lethal regulates back-splicing and generation of the sex-differentially expressed circular RNAs
IF:19.160
期刊:Nucleic Acids Res
通訊作者:徐永鎮(zhèn)(武漢大學(xué)生命科學(xué)院RNA研究所)
發(fā)表日期:2023-04-18
DOI:?10.1093/nar/gkad280
摘要:
與典型剪接相反,反向剪接將上游的3'剪接位點(diǎn)(SS)與下游的5'剪接位點(diǎn)連接起來,產(chǎn)生外顯子環(huán)狀RNA (circRNAs),這些環(huán)狀RNA被廣泛鑒定并在真核基因表達(dá)中具有調(diào)節(jié)功能。然而,性別特異性的果蠅背剪接尚未被研究,其調(diào)控仍不清楚。
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在文中作者對各種性別特異性果蠅樣本進(jìn)行了多次RNA分析,并鑒定了超過10,000個環(huán)狀RNA,其中數(shù)百個是性別差異和特異性后剪接的。有趣的是,作者發(fā)現(xiàn)SXL(一種由性致死性(SXL)編碼的RNA結(jié)合蛋白)的表達(dá)促進(jìn)了雄性S2細(xì)胞中許多雌性差異環(huán)狀RNA的反剪接,而SXL突變體(SXLRRM)的表達(dá)并沒有促進(jìn)這些事件。SXL是果蠅性別決定基因的主要基因,在雌性中只被剪接成功能蛋白。利用單克隆抗體,作者進(jìn)一步通過PAR-CLIP獲得了SXL的轉(zhuǎn)錄組全RNA結(jié)合位點(diǎn)。在對SXL結(jié)合位點(diǎn)突變的小基因進(jìn)行剪接分析后,作者發(fā)現(xiàn)SXL結(jié)合在pre- mRNA的側(cè)翼外顯子和內(nèi)含子上促進(jìn)了反向剪接,而SXL結(jié)合在circRNA外顯子上抑制了反向剪接。
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該研究提供了強(qiáng)有力的證據(jù),證明SXL在反向剪接中具有調(diào)節(jié)作用,從而產(chǎn)生性別特異性和差異環(huán)狀RNA,并通過典型的前剪接啟動性別決定級聯(lián)。
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二、circSMAD4通過海綿miR-135a-5p靶向Janus?Kinase 2促進(jìn)實(shí)驗(yàn)性結(jié)腸炎和損害腸道屏障功能
標(biāo)題:circSMAD4 Promotes Experimental Colitis and Impairs Intestinal Barrier Functions by Targeting Janus Kinase 2 Through Sponging miR-135a-5p
IF:10.020
期刊:J Crohns Colitis
發(fā)表日期:?2023- 04-19
通訊作者:湯黎明(南京醫(yī)科大學(xué)附屬常州市第二人民醫(yī)院)
DOI:?10.1093/ecco-jcc/jjac154
摘要:
背景與目的:已有大量研究探討了環(huán)狀RNA(circular RNAs, circRNAs)與克羅恩病(Crohn's disease, CD)之間的關(guān)系。然而,circRNAs在CD中的病理作用、生物學(xué)功能和分子機(jī)制尚未完全闡明。
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方法:應(yīng)用circRNA芯片分析結(jié)腸組織中差異表達(dá)的circRNA。通過實(shí)時熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(quantitative real-time polymerase chain reaction, qRT-PCR)對鑒定的circRNA進(jìn)行驗(yàn)證。作者進(jìn)行了體內(nèi)和體外功能研究,以驗(yàn)證circSMAD4在CD中的作用并探討相關(guān)機(jī)制。
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結(jié)果:作者發(fā)現(xiàn)circSMAD4是上調(diào)最顯著的circRNA。circSMAD4表達(dá)水平與炎癥因子水平呈正相關(guān)。過表達(dá)circSMAD4可損傷緊密連接[TJ]蛋白并促進(jìn)上皮細(xì)胞凋亡。這些作用可被miR-135a-5p mimic逆轉(zhuǎn)。機(jī)制研究表明,circSMAD4通過“吸附”miR-135a-5p調(diào)節(jié)Janus Kinase 2 [JAK2]來發(fā)揮其對CD的影響。通過微球遞送Si-circSMAD4改善了IL-10敲除小鼠的實(shí)驗(yàn)性結(jié)腸炎,并保護(hù)了腸屏障功能。
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結(jié)論:circSMAD4通過miR-135a-5p/JAK2信號軸調(diào)控實(shí)驗(yàn)性結(jié)腸炎的進(jìn)展,其可能是一個潛在的治療靶點(diǎn)。

