大家都知道“銅死亡”最近很火，都在瘋狂發(fā)生信文章，小云也很關(guān)注，畢竟咱可是走在生信發(fā)文前線的吃瓜群眾，得給粉絲朋友們提供最新的分析方向和思路。

前段時間在pubmed上搜“銅死亡”還只是寥寥幾篇文章，還想著在腫瘤中做分析的話應(yīng)該還不算晚，還有不小的空間能吃到熱點(diǎn)紅利。

結(jié)果····

啪啪打臉啊，朋友們，大意了，隔了一段時間再去看，銅死亡生信文章已經(jīng)有幾十篇了，并且腫瘤中都做到銅死亡相關(guān)lncRNA了，你說卷不卷？

但是，再卷咱也不能往后退，熱點(diǎn)該蹭還得蹭，就是得換個方式、換個領(lǐng)域。這不，小云發(fā)現(xiàn)這個情況之后，第一時間就趕緊給大家找突破口。茫茫腫瘤生信分析中，只有1個非腫瘤分析文章鶴立雞群，突破口就是它了，下面該怎么做朋友們應(yīng)該曉得了吧？

需要復(fù)現(xiàn)或定制分析思路的朋友歡迎call小云，風(fēng)里雨里小云公眾號等你！

文章題目：阿爾茨海默病中銅死亡相關(guān)分子簇的鑒定和免疫學(xué)特征分析

發(fā)表雜志：Frontiers in Aging Neuroscience

影響因子：IF=5.702

發(fā)表時間：2022年7月

研究背景

研究表明，線粒體功能障礙引起的能量代謝不足和氧化應(yīng)激可能是?AD?進(jìn)展的關(guān)鍵發(fā)病機(jī)制。銅穩(wěn)態(tài)主要依賴于線粒體的調(diào)節(jié)，因此，可以合理地推斷銅死亡與?AD?的發(fā)展密切相關(guān)。然而，AD?中銅死亡的潛在調(diào)控機(jī)制仍然未知，因此，進(jìn)一步闡明銅下垂相關(guān)基因（CRGs）的分子特征或許能夠解釋AD異質(zhì)性的原因。

數(shù)據(jù)來源

研究思路及結(jié)果

文章首先檢查了正常人和?AD?個體之間差異表達(dá)的?CRGs?和免疫特征。基于?13?個?CRGs?表達(dá)情況，將?310?名?AD?患者分為兩個與銅死亡相關(guān)的簇，并進(jìn)一步評估了兩個簇之間的表達(dá)模式和免疫細(xì)胞差異。隨后，使用WGCNA算法識別出簇特異性DEG，并基于簇特異性DEG闡明豐富的生物學(xué)功能和途徑。此外，通過比較多種機(jī)器學(xué)習(xí)算法，建立了揭示具有不同分子簇的患者的預(yù)測模型。列線圖、校準(zhǔn)曲線、決策曲線分析和兩個外部數(shù)據(jù)集用于驗證預(yù)測模型的性能。

還是沒搞明白？

沒關(guān)系

看圖

文章小結(jié)

這個文章分析思路的亮點(diǎn)就是分別作了2塊WGCNA，將模塊基因取交集以后再利用多種機(jī)器算法構(gòu)建模型?；阢~死亡基因直接分析放在腫瘤中還是比較常規(guī)的（畢竟現(xiàn)在都分析銅死亡相關(guān)lncRNA了），但是挪到非腫瘤疾病領(lǐng)域還是相當(dāng)夠用的，這也是個搶占非腫瘤版塊銅死亡分析的大好時機(jī)，千萬不要錯過喲！

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