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circRNA新文速遞(2023 AACR)丨Florian Karreth/Thomas B. Hansen團隊最新研究進展

2023-04-25 12:04 作者:circRNA官方號  | 我要投稿

2023年美國癌癥研究協(xié)會年會(AACR)是全球最具影響力的腫瘤學(xué)術(shù)盛會之一,匯集了世界各地專家學(xué)者共享研究進展!我們編譯和整理了在2023 AACR中關(guān)于circRNA領(lǐng)域的最新研究進展,以饗讀者。

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本期關(guān)鍵詞:黑色素瘤;circRNA;過表達;CircAde;癌癥

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一、circPMS1是黑色素瘤中的一種前轉(zhuǎn)移性環(huán)狀RNA

標題:circPMS1 is a pro-metastatic circular RNA in melanoma

期刊:Cancer Res(2023)83(7_Supplement):3743.

作者:Florian Karreth(Moffitt Cancer Center, Tampa, FL)

IN:AACR 2023;Part 1(Regular and Invited Abstracts)

原文鏈接:doi.org/10.1158/1538-7445.AM2023-3743

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摘要

基因表達失調(diào)是黑色素瘤轉(zhuǎn)移的主要驅(qū)動因素,這一過程導(dǎo)致了大多數(shù)與黑色素瘤相關(guān)的死亡。重點是,這些改變不僅限于蛋白質(zhì)編碼的mRNAs,還包括非編碼RNAs。盡管最近有許多研究表明環(huán)狀RNA(circRNAs)與癌癥的發(fā)展有關(guān),但目前尚不清楚它們的紊亂是否會增強黑色素瘤的轉(zhuǎn)移。

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為了確定在黑色素瘤中可能發(fā)揮作用的環(huán)狀RNA,作者對一組黑色素瘤和黑色素細胞系進行了RNA測序。通過qPCR和Sanger測序驗證了21個差異表達的環(huán)狀RNA。進一步分析環(huán)狀和同源線性RNA轉(zhuǎn)錄本的比例以及在更多細胞系中的表達,發(fā)現(xiàn)circPMS1是一種環(huán)狀RNA,通過增強線性PMS1 mRNA的后剪接而在黑色素瘤中上調(diào)。利用轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的傳遞,作者檢測了穩(wěn)定的circPMS1過表達對黑色素瘤細胞的影響。雖然增殖和病灶形成沒有受到影響,但遷移和入侵卻因circPMS1而增強。此外,尾靜脈注射過表達circPMS1的黑色素瘤細胞增加了肺轉(zhuǎn)移。除了這個移植模型,作者還生成了第一個過表達致瘤性環(huán)狀RNA的黑色素瘤基因工程小鼠模型。目前正在分析這些老鼠。從機制上講,作者發(fā)現(xiàn)circPMS1過表達構(gòu)建體的促遷移作用需要環(huán)化。此外,circPMS1含有典型的PMS1起始密碼子、一個預(yù)測的ORF橫跨反向連接點,以及一個預(yù)測的IRES序列。事實上,在過表達構(gòu)建體中插入一個標簽,發(fā)現(xiàn)circPMS1被翻譯成一個截斷的25kDPMS1蛋白,以及一個可能產(chǎn)生于一個框內(nèi)的下游起始密碼子的20kD蛋白。重要的是,這些截斷的circPMS1蛋白是內(nèi)源性表達的,與黑色素細胞相比,在黑色素瘤中表達增加,而全長的PMS1蛋白是均勻表達的。

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這些發(fā)現(xiàn)表明,circPMS1至少部分地通過編碼截短的circPMS1蛋白來促進黑色素瘤的轉(zhuǎn)移。進一步的工作將確定circPMS1編碼蛋白的功能及其在推動黑色素瘤進展和轉(zhuǎn)移中的作用。

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二、CircAde:一種基于circRNA的系統(tǒng),用于延長和更有效的治療癌癥

標題:a circRNA-based system for prolonged and more effective treatment of cancer

期刊:Cancer Res 2023;83(7_Suppl):Abstract nr 5335

作者:Thomas B. Hansen(Targovax ASA)

IN:AACR 2023;Part 1(Regular and Invited Abstracts)

原文鏈接:doi.org/10.1158/1538-7445.AM2023-5335

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摘要

在最近進行的I/II期臨床研究中,作者成功地將載體轉(zhuǎn)基因編碼的mRNA有效載荷輸送到實體腫瘤,獲得了顯著的臨床效果。在患者中,持續(xù)和長期的轉(zhuǎn)基因表達與陽性的臨床結(jié)果相關(guān),因此轉(zhuǎn)基因表達譜的時間延長有望進一步提高治療效果。

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環(huán)狀RNA(CircRNA)是近年來被發(fā)現(xiàn)的一類新的內(nèi)源性表達的RNA。circRNAs不同于mRNAs,它能抵抗核外降解,從而在細胞內(nèi)保持較高的穩(wěn)定性和持續(xù)表達。因此,基于circRNA的系統(tǒng)是一種有趣的新技術(shù),可以延長治療效果。

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在這里,作者展示了專有的載體系統(tǒng)circAde,它允許通過剪接體依賴的生物發(fā)生來高表達circRNAs。通過比較circAde和基于mRNA的載體的蛋白質(zhì)輸出,發(fā)現(xiàn)circAde系統(tǒng)在轉(zhuǎn)基因產(chǎn)量和表達的時間可持續(xù)性方面都優(yōu)于傳統(tǒng)的基于mRNA的設(shè)計。此外,證明了某些設(shè)計特征對circRNA的生產(chǎn)和隨后的載體蛋白質(zhì)表達有很大影響。沒有5’帽的circRNA依賴于IRESs(內(nèi)部核糖體進入序列)進行有效翻譯。通過對1000多個假定的IRES元件進行兩次正交IRES篩選,作者已經(jīng)在黑色素瘤和肺癌細胞中確定了支持有效circRNA生產(chǎn)和高產(chǎn)蛋白質(zhì)表達的最有效的IRES序列,從而進一步改進了circAde載體系統(tǒng)。這項研究結(jié)果為開發(fā)新的、更有效的癌癥治療策略和其他需要持久轉(zhuǎn)基因表達的環(huán)境開辟了一個新的平臺。??


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