第一問：RIN值是什么？

RIN全稱RNA integrity number，是安捷倫公司開發(fā)的應用于自動化電泳系統(tǒng)2100生物分析儀中用來評價RNA完整性的一個指標。

?

第二問：為什么要測RNA完整性？

評價RNA完整性是核酸質控的一種，對后續(xù)實驗的準確性很重大意義?？梢员豢醋鍪谦@得有意義基因表達數(shù)據(jù)的第一個關鍵步驟。采用完整的RNA是下游做基因定量，測序等實驗成功的關鍵要素。

?

第三問：RIN值是如何開發(fā)的？

RIN值是針對使用安捷倫2100生物分析儀檢測真核生物總RNA系統(tǒng)來開發(fā)的。安捷倫應用科學家采集了來自于人，大鼠，小鼠的不同組織約1300份樣本的總RNA數(shù)據(jù)，并對其進行分析。所有的樣本RNA完整程度都不相同。科學家們預設了1-10的編號，并將這些樣本手動分類至對應的編號（數(shù)字越大，完整性越好）。

?

RIN算法是基于神經(jīng)網(wǎng)絡等自適應學習工具開發(fā)而成。這些學習工具可以從電泳圖中提取的關鍵特征，例如信號面積，強度和比值。以圖1舉個列子，電泳圖被分為不同區(qū)域（前區(qū)、5S區(qū)、快速區(qū)、中區(qū)、前體區(qū)、后區(qū)）和峰（標準品、18s、28s）。安捷倫2100生物分析儀配套分析軟件可以根據(jù)檢測結果生成RIN值。

第四問：RIN值怎么看？

RIN值可以設置為整數(shù)，見圖2。 數(shù)字越大，代表RNA完整性越高，數(shù)字越小，表示RNA降解的越厲害。一般在測序應用中，一般推薦RIN值要大于7；若RIN＜6，會建議重新送樣；RIN在6-7之間，存在測序風險。

第五問：RIN值如何應用？

用安捷倫2100生物分析儀測量RIN值是檢測RNA完整性的有力工具。在提取樣本RNA之后檢測RIN值，同時需要和下游實驗例如qPCR等建立關聯(lián)，設定一個下游實驗成功與否的RIN閾值。該閾值可作用于標準RNA質量控制。檢測的RIN值大于閾值的樣本通過質控QC檢驗，而低于閾值的樣本則要被去除。

第六問：為什么選擇檢測RIN值？

?更加快捷，省時

相比較于傳統(tǒng)人工電泳實驗，采用安捷倫2100生物分析儀，一次可以同時檢測5-12樣本，節(jié)省時間。

?減少實驗步驟，省力

安捷倫2100生物分析儀搭配檢測芯片，無需配膠，無需手動跑膠，大大減少了繁瑣的實驗流程，相應的也減少了人為誤差。

?準確度高，省心

經(jīng)過實驗論證，采用RIN值計算RNA完整性的變異系數(shù)是為1.4%，遠低于采用核糖體比率計算的結果。在不同濃度的樣品中，RIN評估的結果也高于核糖體比率。使用RIN值完全可以作為評估RNA完整性的靠譜標準！

今天的分享就到這里了，下一次小編魯大師會給您帶來如何用安捷倫2100生物分析儀做實驗哦。青山不改，綠水長流！我們下周再見！

關注：優(yōu)寧維分子生物學，更多探索可供你探討呦~